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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004152`

染色体: Chr04 坐标: 56226826-56232430 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004152`
名称	SmilChr04G004152
描述	uncharacterized SmilChr04G004152
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56226826 - 56232430 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021033`
GeneID	`131021033`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021033`
原始查询	`SmilChr04G004152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PAS domain-containing protein tyrosine kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835007]; symbol=AT5G49470; hit=AT5G49470; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PAS domain-containing protein tyrosine kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835007]; symbol=AT5G49470; hit=AT5G49470; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G49470` (AT5G49470) PAS domain-containing protein tyrosine kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835007] identity=63.6; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0562500` - identity=57; qcov=0.606; evalue=4.1e-158; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00989 (PAS); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08447 (PAS_3); PF08448 (PAS_4); PF13188 (PAS_8); PF13426 (PAS_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021033

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806094.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806094.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806094.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806094.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56227949`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A19,A21,A3,B114,B12,B17,B33,B35,B91,B94
`Chr4:56227985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:56228582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C80
`Chr4:56228623`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A19,A21,A3,B112,B114,B12,B17,B24,B25,B3,B33,B35,B37,B46,B51,B64,B78,B79,B82,B83,B91,B94,B97,C10,C13,C14,C2,C27,C3,C40,C75,C86
`Chr4:56228633`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A19,A21,A3,B112,B114,B12,B17,B24,B25,B3,B33,B35,B37,B46,B51,B64,B78,B79,B82,B83,B91,B94,B97,C10,C13,C14,C2,C27,C3,C40,C75,C86
`Chr4:56228645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B132,C22,C29
`Chr4:56228751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:56229021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C73
`Chr4:56229039`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A19,A21,A3,B112,B114,B12,B17,B24,B25,B3,B33,B35,B46,B51,B64,B78,B79,B82,B83,B91,B94,B97,C10,C13,C14,C2,C27,C3,C40,C75,C86
`Chr4:56229328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:56229407`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A19,A21,A3,B112,B114,B12,B17,B24,B25,B3,B33,B35,B37,B46,B51,B64,B78,B79,B82,B83,B91,B94,B97,C10,C13,C14,C2,C27,C3,C40,C75,C86,D11
`Chr4:56229487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806094.1

779 aa

390

779

PAS_8

PAS

PAS_4

PAS_9

PAS_3

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF13188 PAS_8 131-187 aa PF00989 PAS 131-238 aa PF08448 PAS_4 137-240 aa PF13426 PAS_9 147-240 aa PF08447 PAS_3 152-237 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 505-757 aa PF00069 Pkinase 507-755 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF13188`	PAS_8	Domain	131	187	3.2e-06	27.5	PAS domain
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF00989`	PAS	Domain	131	238	1.4e-14	54.8	PAS fold
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF08448`	PAS_4	Domain	137	240	8.8e-11	42.7	PAS fold
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF13426`	PAS_9	Domain	147	240	5.9e-12	46.5	PAS domain
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF08447`	PAS_3	Domain	152	237	1.5e-06	29.1	PAS fold
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	505	757	7.7e-69	232.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057806094.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	507	755	2.5e-58	198.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950111.1
AAAAACTATAATATATAAAAATATAATAATTCATCGCATTTAAATAATGAAATTGATTGGAGCTGGTTGTTAATTGTTTATACCTTTTTCTGAAAGAAAAAAGCTGAAGAAGAAAATGATGGCCCACGCTCGGCGGATTCCGTGAGTTGCACGCACTGATGGTCGATCACTTACTCGATCTTTGATTGGGTAATTCACAGTTAGTGTAACGCACGCGCCATTTTGGCGAAGGGGGCTCGAAAATGAAGGTCAAATCTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021033
ATGGAGAGCGGTGCCGAGCAATCACCAGCAGCGTCATCTTCGGCGGCGCCGCCAGCTGAGGAGCTGCTGAAGAAGATTCAGGATTTAGAATTAGGTCACGCCCACTTGAAGCACGAGATGTCTAAGCTTATCACTACTTCCACAGCTGAAATCTTGGCGGCTGATCGCCGGCAGAAGCAGAGGTCCCACTCCATTTCGCCGCAGCGGGGGCCGCGGTGGAGGACCGGCGGCGGAGATGCTAATTCGGTGGCGGCGTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806094.1
MESGAEQSPAASSSAAPPAEELLKKIQDLELGHAHLKHEMSKLITTSTAEILAADRRQKQRSHSISPQRGPRWRTGGGDANSVAAWKKGSATFRHSSPLQRESHSTDSWTAGGGRGGGGHGPAAVKLTDKQYLNILQSMGQSVHIFDLNFRIIYWNKSAEKLYGYSAAEALGQDAIELLTDPQDSAVASNIVRRVAAGENWTGQIPVKNKRGDRFLAVATNTPFYDDEDTLVGVICVSSDSRPFVEAQTVNSELSDSGTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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