当前解析结果
SmilChr04G004165| 统一新 Gene ID | SmilChr04G004165 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G004165 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G004165 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 56307101 - 56309170 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021048 |
|---|---|
| GeneID | 131021048 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021048 |
| 原始查询 | SmilChr04G004165 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | nucleolin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841215]; symbol=AT1G47970; hit=AT1G47970; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | nucleolin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841215]; symbol=AT1G47970; hit=AT1G47970; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G47970 (AT1G47970)nucleolin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841215] identity=67.9; qcov=0.468; evalue=5.95e-11; confidence=low |
| Rice | Os01g0332900- identity=58.6; qcov=0.335; evalue=2.03e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021048 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806111.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057806111.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057806111.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806111.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806111.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:56307424 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr4:56307586 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C38 |
Chr4:56308722 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C10 |
Chr4:56308801 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。