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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004174`

染色体: Chr04 坐标: 56358324-56360612 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004174`
名称	SmilChr04G004174
描述	probable protein phosphatase 2C 47
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56358324 - 56360612 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021061`
GeneID	`131021061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021061`
原始查询	`SmilChr04G004174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 47
产物	probable protein phosphatase 2C 47
Arabidopsis	`AT3G62260` (AT3G62260) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825399] identity=50.1; qcov=1.03; evalue=5.95e-128; confidence=high
Rice	`Os05g0134200` (OsPP2C47) - identity=60.5; qcov=0.837; evalue=3.66e-124; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0043169 (cation binding)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806122.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806122.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806122.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806122.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56358605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B36,B90,B92,C39
`Chr4:56358686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:56358754`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B42
`Chr4:56358754`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B42
`Chr4:56358759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr4:56358806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:56359042`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	159	A10,A13,A14,A15,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A9,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B124,B127,B128,B13,B130,B133,B136,B139,B140,B16,B17,B19,B21,B22,B26,B27,B3,B30,B33,B35,B36,B37,B42,B43,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B72,B73,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B95,B96,C10,C11,C13,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C41,C44,C47,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C6,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C81,C82,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D3,D6,D7
`Chr4:56359044`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	159	A1,A10,A13,A14,A15,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A9,B1,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B124,B127,B128,B13,B130,B133,B136,B139,B140,B16,B17,B19,B21,B22,B26,B27,B3,B30,B33,B35,B36,B37,B42,B43,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B72,B73,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B95,B96,C10,C11,C13,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C41,C44,C47,C5,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C6,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C81,C82,C85,C86,C87,D10,D11,D2,D3,D6,D7
`Chr4:56359130`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	174	A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A24,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B103,B104,B105,B11,B111,B112,B113,B115,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B18,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B53,B55,B57,B59,B60,B61,B63,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B92,B94,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D4,D7,D8,D9
`Chr4:56359156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:56359190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B129,B14,B38,B39
`Chr4:56359382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806122.1

381 aa

190

381

PP2C

PF00481 PP2C 84-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806122.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	84	339	7.1e-69	233.0	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950139.1
TTAATCTAGCCGCAATACATATCGTTATGAAAGAGGATAGCGCGTGGCGTCGGATACTTTTCCTATTACCACTAGGGTTAAGTTTCTCTTCTCCCCTAATTCAAATATCAACCCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTTCCTCTTTCCTCAATCAACAAACAATCCACAATAAAACGAACAATCTCTCTCCAATTCTCCTACAAACAACCGGAAGCAAGCCCAGAGCCGTAAGAATTTTGTTAGGATCGCTGCGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021061
ATGGTGGCAGAAGCGGAGTTTGTATGTCATCCAACCGTCGCCTTTCAATGCATTCGCGTTCCCCCGCCTAATCTTCAATCGGATTTCTTCGACATGTCGCAGCCCGATACCGCTGCGCCTATTCCCGTCGACCTCTCTCGTCGTGAATCGGCGCTGAGCTGCTCAACTAGTTTACAAATTACCAAAGCATCTGAGACTTCGACCAGAAAGTTTGTTCCAAGAATTCGATCGGGCAGCCACACTGATATTGGACCTCGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806122.1
MVAEAEFVCHPTVAFQCIRVPPPNLQSDFFDMSQPDTAAPIPVDLSRRESALSCSTSLQITKASETSTRKFVPRIRSGSHTDIGPRSSNEDEHIRIDDLCSHLGSLYSWSEPSSFYAVFDGHGGPGAAAFMKNNTMKFFFEDAELPQTSDVEETFLQAFETCHRRSYLQADQALADDLNVDSYCGTTALTVLVHGRNLLIANAGDCRAVLCRKGGAVQLSQDHRPSCQVEKERVEDLGGSIEYGYLNGELAVTRALGDWY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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