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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004179`

染色体: Chr04 坐标: 56376941-56383053 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004179`
名称	SmilChr04G004179
描述	uncharacterized SmilChr04G004179
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56376941 - 56383053 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021069`
GeneID	`131021069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021069`
原始查询	`SmilChr04G004179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	wall-associated receptor kinase carboxy-terminal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820998]; symbol=AT3G17350; hit=AT3G17350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	wall-associated receptor kinase carboxy-terminal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820998]; symbol=AT3G17350; hit=AT3G17350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17350` (AT3G17350) wall-associated receptor kinase carboxy-terminal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820998] identity=64.5; qcov=0.918; evalue=1.66e-114; confidence=high
Rice	`Os05g0409100` - identity=35; qcov=0.91; evalue=1.01e-47; confidence=medium
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind); PF14380 (WAK_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806132.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806132.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806132.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806132.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56377426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B82
`Chr4:56382499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:56382699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806132.1

279 aa

140

279

GUB_WAK_bind

WAK_assoc

PF13947 GUB_WAK_bind 21-79 aa PF14380 WAK_assoc 205-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806132.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	21	79	1.8e-10	41.7	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding
`XP_057806132.1`	Pfam	`PF14380`	WAK_assoc	Domain	205	242	9e-07	30.2	Wall-associated receptor kinase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950149.1
GAATCAAATGGGATAGGTGGGCTGGTATCACTTAGGCCCATTCCTGGATCCGACAAATCCAAAGAAACCAGATGATGATGTTATGTATGAAAAGTCCAAGACAAACCACTCAAATTTCAAACAACACTGTCCTGCCATTGCAGTGCAAATAGTCAAAAAAGCATCCAGCAATTTGCGGTATCAAAAGCAGTGCCTCACCCAAATTCAAACAAAATAATCTATCATCAGTTGAGAAGTTGAAGTCCAAGTCGAGGAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021069
ATGTTGCTTTTGAAAGGCTTGATCATACTTGTACATTTGTCTGCTGCAGCTACCTCCCTCTGCCGCAACTTCTGCAACAACATCCCCATCAACTACCCCTTTGGCATCGACGACGGATGCGGCGCCGCCCAATTCCGCCGCATGCTCAACTGCTCCGCCACCGGCCTCTTCTTCCTCACCCCCTCCGGCAGCTACAAGGTCCAAACCATCGATTACAACAAGAAAAACCTTGTGATATTCGACCCCTCCATGTCCACCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806132.1
MLLLKGLIILVHLSAAATSLCRNFCNNIPINYPFGIDDGCGAAQFRRMLNCSATGLFFLTPSGSYKVQTIDYNKKNLVIFDPSMSTCSILQPHHDFLMTDIQSATIPPSPDTLFLLMNCSIDSPLLNHYRYLCFNFSGHSCDELYGSCTSFKLFHMLSNTTPPCCFTTYDTVKYMSINILDCTHYTSVYNVDSLEGVGPLDWLYGIKLSYSLPELGCDRCAKSGGACGFDVETQGFTCICSSTTNATRDCGGSLNGGKSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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