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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004182`

染色体: Chr04 坐标: 56394557-56396009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004182`
名称	SmilChr04G004182
描述	uncharacterized protein ycf20-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56394557 - 56396009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021071`
GeneID	`131021071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021071`
原始查询	`SmilChr04G004182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0852600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0852600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G56830` (AT3G56830) YCF20-like protein (DUF565) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824850] identity=44; qcov=0.892; evalue=9.56e-29; confidence=medium
Rice	`Os03g0852600` - identity=55.1; qcov=0.747; evalue=3.48e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04483 (DUF565)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806133.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057806133.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057806133.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806133.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56395260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806133.1

158 aa

158

DUF565

PF04483 DUF565 108-157 aa

XP_057806134.1

158 aa

158

DUF565

PF04483 DUF565 108-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806133.1`	Pfam	`PF04483`	DUF565	Family	108	157	2.6e-11	44.4	Protein of unknown function (DUF565)
`XP_057806134.1`	Pfam	`PF04483`	DUF565	Family	108	157	2.6e-11	44.4	Protein of unknown function (DUF565)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100831.1
GCCGACACGTAACAAAGGCCCAATAAGTGGCCCGATACGGACAAAGGCCCAATAGAAGGTACGACGGTTAAGGACTGTTTTAGCAGCTGGCGATCTCCGGCTACTCCGCTCTGCTTCTCTACCAAGTAAAGCGAGTTCCTCCAATTCATGGTGGGAACAATCGAGCTGCAGCTCTTTCTCCTACCTAGACATTCTAAATCAAGGGCGGATTGGCCATTTTCCGCCACCAGATTCAAGTGAGTGTGAGTGTGAGTGTGAGT...

XM_057950150.1
CGGCTACTCCGCTCTGCTTCTCTACCAAGTAAAGCGAGTTCCTCCAATTCATGGTGGGAACAATCGAGCTGCAGCTCTTTCTCCTACCTAGACATTCTAAATCAAGGGCGGATTGGCCATTTTCCGCCACCAGATTCAAGAATAGGAATAGGAGCAAGTGGTGGTGGTGTGTTGGAAGTAGAAGCGCAGGCGATGGCGATGATAATTCAAATTCAAATGGGAGCACAAGCACAAGGCTTATTAGGAGTATCCAAGGTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021071
ATGGTGGGAACAATCGAGCTGCAGCTCTTTCTCCTACCTAGACATTCTAAATCAAGGGCGGATTGGCCATTTTCCGCCACCAGATTCAAGAATAGGAATAGGAGCAAGTGGTGGTGGTGTGTTGGAAGTAGAAGCGCAGGCGATGGCGATGATAATTCAAATTCAAATGGGAGCACAAGCACAAGGCTTATTAGGAGTATCCAAGGTCTCCAGTTGAAGCTAATTGCAAGACTAAAGGAGCTAAGCAATAAGCTGCCTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806133.1
MVGTIELQLFLLPRHSKSRADWPFSATRFKNRNRSKWWWCVGSRSAGDGDDNSNSNGSTSTRLIRSIQGLQLKLIARLKELSNKLPAKVFSFLAGFYCSTAFASVIGQTGDWDVLSAALAVALVEAMYKYKPKRNFIVILNYCKAGLSLGLFLDSFKY

XP_057806134.1
MVGTIELQLFLLPRHSKSRADWPFSATRFKNRNRSKWWWCVGSRSAGDGDDNSNSNGSTSTRLIRSIQGLQLKLIARLKELSNKLPAKVFSFLAGFYCSTAFASVIGQTGDWDVLSAALAVALVEAMYKYKPKRNFIVILNYCKAGLSLGLFLDSFKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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