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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000005`

染色体: Chr05 坐标: 19409-21470 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000005`
名称	SmilChr05G000005
描述	uncharacterized SmilChr05G000005
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	19409 - 21470 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026490`
GeneID	`131026490`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026490`
原始查询	`SmilChr05G000005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539]; symbol=AT4G33940; hit=AT4G33940; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539]; symbol=AT4G33940; hit=AT4G33940; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G33940` (AT4G33940) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829539] identity=37.3; qcov=0.791; evalue=1.6e-40; confidence=medium
Rice	`Os03g0839000` (OSJNBa0042I09.10) - identity=33.9; qcov=0.686; evalue=1.48e-24; confidence=low
GO	GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026490

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057812340.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057812340.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812340.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812340.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:19614`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	61	A13,A14,A15,A16,A18,A2,A21,A24,B100,B103,B105,B113,B118,B119,B124,B129,B13,B132,B134,B135,B138,B140,B21,B23,B28,B35,B40,B45,B48,B49,B54,B62,B76,B8,B81,B83,B9,B93,C10,C11,C12,C15,C16,C25,C32,C41,C48,C58,C59,C64,C65,C66,C68,C69,C70,C72,C78,C80,C83,C85,C9
`Chr5:19622`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A13,A14,A16,A18,A21,A24,A7,B103,B105,B113,B118,B119,B124,B129,B131,B132,B134,B135,B138,B21,B23,B28,B33,B35,B40,B45,B46,B48,B49,B54,B62,B76,B8,B81,B83,C12,C15,C16,C2,C25,C32,C47,C48,C58,C59,C64,C65,C66,C68,C72,C74,C78,C80,C83,C85,D7
`Chr5:19626`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	178	A10,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B32,B34,B35,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B47,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B59,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B74,B75,B77,B78,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B97,B98,B99,C12,C13,C15,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C38,C40,C44,C45,C46,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C63,C64,C66,C68,C7,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D8,D9
`Chr5:20180`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C69
`Chr5:20180`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812340.1

258 aa

129

258

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

PF13445 zf-RING_UBOX 84-124 aa PF00097 zf-C3HC4 84-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812340.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	84	124	5.9e-08	33.3	RING-type zinc-finger
`XP_057812340.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	84	126	2.2e-06	28.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956357.1
AAATAGAGTGGGACCAGCATTGGACAGCATGCAACGTGTCGTCACCGTTGCTCCATTAGTGGAAGCAATTATGCGGTGAATCGCCGCCTTCTATCCCTAACCGACGAAAAAGCACAAATTTCCCACATTTTACATGGCAAAAATTCTTGCAGATCGCCAAAATTGAGGGATTTCAACCCTCTCATAATATGCATGTTTTGTTTAACTAAAAAAAAGAAGAAGATGAAATTAAGAATGGAGTTAGCAGAGAATCATCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026490
ATGTTTTGTTTAACTAAAAAAAAGAAGAAGATGAAATTAAGAATGGAGTTAGCAGAGAATCATCTTCCCGGAATCGAAGCGGAAAGCAACGCCATTGTTGTTGCGAGCAGATTTCAAATGGAAAAAGAAGCTGGAGCTGTTGGAGTTGGAGAATATCGAGATGGTTATGTAGATTTGAGAAAAAAAGAAGACGAAAACGGAATTGGAATTGGAATTGAAGATGGAGATTTTGGCGCCGGTGATGATGTCTGCCCCATCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812340.1
MFCLTKKKKKMKLRMELAENHLPGIEAESNAIVVASRFQMEKEAGAVGVGEYRDGYVDLRKKEDENGIGIGIEDGDFGAGDDVCPICLDAFTFPCRSNCGHLFCAACILQLWMYRYSIQPCKCPLCCCRIVNLELQITSEQADYGGEVRKEVQHYNGLYISGLFGALHILPLLMGRVFRVLVDLDYLRCIYYVMRIIGLFLGLLYERLEFEFLPTGGLGIQRTFDLIASMLVAALFLIGVVCRWMLKRRARLFVVGDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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