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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000008`

染色体: Chr05 坐标: 37826-42035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000008`
名称	SmilChr05G000008
描述	phytochrome-associated serine/threonine-protein phosphatase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	37826 - 42035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026492`
GeneID	`131026492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026492`
原始查询	`SmilChr05G000008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytochrome-associated serine/threonine-protein phosphatase
产物	phytochrome-associated serine/threonine-protein phosphatase
Arabidopsis	`AT3G19980` (FYPP3) flower-specific, phytochrome-associated protein phosphatase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821536] identity=98; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0691700` (OsPP13) - identity=93.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812342.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812342.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057812342.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057812342.1`
5	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057812342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38777`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38777`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38779`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38779`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38782`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:38782`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A10,B108,B83,C66
`Chr5:41349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,C12,C21,C83
`Chr5:41488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812342.1

303 aa

152

303

Metallophos

PF00149 Metallophos 44-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812342.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	44	237	9.9e-47	160.6	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956359.1
AACTCAAAGGAAGAAACTCAACTGCTTTTATTGGTAGGCGGAAACATTTGATATAGTCAAAAAGTTGAGGGACATTTTCGAAAATAAGTAAACATTTGGGGAATGAATTTGAAATGTTATTGCGGCAGAAGGGCTGCGAGTGAATCTGGTGTAAACTACGAGTAGTTCCCACTCTCTCCGCCCGCCTCCGCCGGTCCTGCCACGGTCTCCGATCGGCTAACGCCGCCGCTAGGCAGATTCATCTAGCGTCACATATAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026492
ATGGATTTGGACCAATGGATAGCAAAGGTGAAAGACAGCCAGCACTTGTCCGAAGATGAGCTTCAGCTCCTCTGCGAATACGTAAAGGAGATACTGATCGAGGAATCAAACGTTCAGCCTGTCAATAGTCCAGTCACAGTATGTGGGGATATTCATGGGCAGTTTCATGATTTAATGAAACTTTTCCAGACCGGAGGTCACGTACCGGAGACAAATTACATATTTATGGGAGATTTTGTCGATCGTGGCTATAATAGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812342.1
MDLDQWIAKVKDSQHLSEDELQLLCEYVKEILIEESNVQPVNSPVTVCGDIHGQFHDLMKLFQTGGHVPETNYIFMGDFVDRGYNSLEVFTILLLLKARYPANITLLRGNHESRQLTQVYGFYDECQRKYGNANAWRYCTDVFDYLTLSAIIDGTVLCVHGGLSPDVRTIDQIRVIERNCEIPHEGPFCDLMWSDPEDIETWAVSPRGAGWLFGSRVTSEFNHINKLDLVCRAHQLVQEGLKYMFQDKGLVTVWSAPNYC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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