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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000016`

染色体: Chr05 坐标: 68838-70949 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000016`
名称	SmilChr05G000016
描述	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	68838 - 70949 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026503`
GeneID	`131026503`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026503`
原始查询	`SmilChr05G000016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1, chloroplastic
产物	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G17600` (LIL3:1) Chlorophyll A-B binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827479] identity=58.2; qcov=1.07; evalue=7.64e-102; confidence=high
Rice	`Os02g0125700` (OsLIL3) - identity=63.3; qcov=1.02; evalue=1.99e-99; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30879 (LIL3_)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026503

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812360.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057812360.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057812360.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812360.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:69020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B19
`Chr5:69023`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr5:69023`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr5:69027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr5:69027`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr5:69032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr5:69044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:69094`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B123,B127,B138,B44,B53,B82,B85,C58,C75,C84,D10,D2
`Chr5:70529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:70580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr5:70583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:70730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812360.1

239 aa

120

239

LIL3_

PF30879 LIL3_ 84-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812360.1`	Pfam	`PF30879`	LIL3_	Domain	84	160	2.5e-41	140.6	Light-harvesting-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956377.1
ATAACGAGACAAGTCCAAAGGCTCCAATAAATAAAGCCACAAAAAGCTCCACTTTTTCTACGGCCCAAATTCGCCTAACAAAATCATCACTCCAAAACTCTCCCATTTTCGCTTTCGCTTTCTCTCTCTCTCTCAGCTCACTCCAGTGAATCCCAATTTCTCAGAAATGTCGATGGCCATTTTCTCCCCAAAGCTTCCATCTTTGGCGCCGCAGTCTCACGCCAAAACCCATTTAGGTTTGAGGCCTAATTACCTCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026503
ATGTCGATGGCCATTTTCTCCCCAAAGCTTCCATCTTTGGCGCCGCAGTCTCACGCCAAAACCCATTTAGGTTTGAGGCCTAATTACCTCCCTCTCAGGCCCATCCAGAAGCTTCACGCCGATAGCGCCTCTGGTGTGGCCGTCACTGCGCCGGCGGAGACTGCTGTCGCTTCTGCTGAGGAGTCTCTTGGCTCCAATGGCTCCGCGATGGCGGCGGCGGCGGTTACGGCGGTGGAGGCTGTGGACGGTTTTCAGGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812360.1
MSMAIFSPKLPSLAPQSHAKTHLGLRPNYLPLRPIQKLHADSASGVAVTAPAETAVASAEESLGSNGSAMAAAAVTAVEAVDGFQDARWVGGTWDLKQFEKDGKTDWDAVIDAEVKRRKWMQDSPQSSSNDEPVVFDTSIIPWWAWMKRFHLPEAELLNGRAAMVGFFMAYFVDSLTGVGLVDQMGNFFCKTLLFVAVAGVLLIRKNEDFETIKKLVDETTFYDKQWQAAWQDETSENK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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