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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000018`

染色体: Chr05 坐标: 75094-79727 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000018`
名称	SmilChr05G000018
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	75094 - 79727 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026504`
GeneID	`131026504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026504`
原始查询	`SmilChr05G000018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B
产物	dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B
Arabidopsis	`AT1G34130` (STT3B) staurosporin and temperature sensitive 3-like b [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840312] identity=87; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0675500` (Stt3a) - identity=84.8; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004576 (oligosaccharyl transferase activity); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02516 (STT3); PF21436 (STT3-PglB_core)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057812361.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057812361.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:75515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C43
`Chr5:75548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:75551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C81
`Chr5:75569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B19
`Chr5:75722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:76360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:76385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr5:76400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr5:76478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D10
`Chr5:76599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:76610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:76613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812361.1

731 aa

366

731

STT3

STT3-PglB_core

PF02516 STT3 42-437 aa PF21436 STT3-PglB_core 554-612 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812361.1`	Pfam	`PF02516`	STT3	Domain	42	437	3.7e-118	396.3	Oligosaccharyl transferase STT3, N-terminal
`XP_057812361.1`	Pfam	`PF21436`	STT3-PglB_core	Domain	554	612	1.7e-05	26.0	STT3/PglB/AglB core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956378.1
TTTCTTCTTTTTTCTACAGAACAGACAAAATATACTCCAAGTCTCCAACTATTTCCAAATAATAGAGACAAAATTTGTTACTAATGATAATCATTTTTTTTTTTTTTAAAGATTGGAAAGTAATATGGTTGGACAAACAAGTCCTTGCCCAAATGTCTAAAGAGCTTGAAAATGGAGTAGGGTTTAATAACTGAATCTCATTTCCTCAAAATCAACATGGATCTCCTCAACTAAATCAATTCTCCCCAAAACCCCAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026504
ATGGTCGCAGCGAAAATGGAGAAATCCGCTGCGGATCTGCTGGCATCGCCGGGGGTGAGCTCGCTGCTGAAATCCCTCAAGCTCAAGACGAAGCAGCAGGAGCTCCTGATCCGCGTCTCGGTGCTCTTCTTGGTCTACGTGTTGGCGTTCATCACTCGCCTCTTCAGCATCCTGCGCTACGAGAGCATGATCCACGAGTTTGACCCCTATTTCAATTACCGAGTCACTCAGTTCCTGACTCGGAACGGCTTCTATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812361.1
MVAAKMEKSAADLLASPGVSSLLKSLKLKTKQQELLIRVSVLFLVYVLAFITRLFSILRYESMIHEFDPYFNYRVTQFLTRNGFYEFWNWFDYESWYPLGRIVGGTLYPGLMVTAAFIYWTLRFFRFAVHIREVCVLTAPFFAANTTIVAYFFGKELWDSGAGLVAAVLIAICPGYISRSVAGSYDNEGVAIFALLLTFYLFVKAVNTGSLAWALASAFGYFYMVSAWGGYVFIINLIPLYVLVLLITGRYSMRLYVAYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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