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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000025`

染色体: Chr05 坐标: 129401-132645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000025`
名称	SmilChr05G000025
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	129401 - 132645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026513`
GeneID	`131026513`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026513`
原始查询	`SmilChr05G000025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=24.9; qcov=0.968; evalue=2.36e-39; confidence=weak
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=25.9; qcov=0.854; evalue=1.68e-38; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026513

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812371.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812371.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812371.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812371.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:129633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C64,C66
`Chr5:129660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:129678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A3,B104,B41,B52,B53,B55,B58,B82,C27,C29
`Chr5:129701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,C6,C77,C81
`Chr5:129766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B78,C65
`Chr5:129800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:129827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B12,B124,C22,C43
`Chr5:129932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:129956`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr5:129956`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B79
`Chr5:129959`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B79
`Chr5:129959`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812371.1

868 aa

434

868

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 171-324 aa PF23598 LRR_14 535-827 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812371.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	171	324	5.1e-26	92.0	NB-ARC domain
`XP_057812371.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	535	827	6.4e-17	62.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956388.1
ATAGCAGCAGAGAGCTAAAGATGTATCATTAATTTGTTTCATCTCCATTTGCTTATTAGTATAATTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCGTTTCTTTCTTAGGCGATTTCTACCACAGAGTTTTGGAGGAAAATTTCTGAGCTAAGTTTCCGGAAGTAATTTTATTTCAACGAGCAGCAGATTATTTGGATATGGCGGCTTATGGTGCGGCAGCTTCTCTCAAGAATACCATTCAGCGTATTCCACAATCATCTCACATTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026513
ATGGCGGCTTATGGTGCGGCAGCTTCTCTCAAGAATACCATTCAGCGTATTCCACAATCATCTCACATTTCTCTCGATTCCCACTCTCCACAAATCTTGCAACCTGCCTACGACCAGATGGATCACTTGCAGATAGTTCTGCTAAGATTGGACAACACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGTGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAGTTTGAAGATTTACTCGAATCTCATGTCTTACATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812371.1
MAAYGAAASLKNTIQRIPQSSHISLDSHSPQILQPAYDQMDHLQIVLLRLDNTSCSKIRTKVNAVDERIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLDSERGSLSFPVELQSLQHRVDCFIEMVKMMEMEFIIEMENMAEEEGEPISSRIDFGGIESKMVGLSHEFQKARDYLLENKHYSIIGMAGIGKTTLAKHIFEDPSIRSHFEFQAWVKVGRKCEPNELLRCVLAQADPNAYQMLAQGDDDEAELVRILNERLKNKKCLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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