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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000029`

染色体: Chr05 坐标: 146217-147062 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000029`
名称	SmilChr05G000029
描述	uncharacterized SmilChr05G000029
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	146217 - 147062 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024710`
GeneID	`131024710`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024710`
原始查询	`SmilChr05G000029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1720_F04.106; symbol=OJ1720_F04.106; hit=Os07g0563400; species=rice; confidence=low
产物	OJ1720_F04.106; symbol=OJ1720_F04.106; hit=Os07g0563400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G54300` (AT5G54300) cotton fiber-like protein (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835518] identity=31.9; qcov=0.972; evalue=2.06e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0563400` (OJ1720_F04.106) - identity=39.5; qcov=0.441; evalue=2.03e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024710

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057810233.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057810233.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057810233.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057810233.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:146386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B13,B2
`Chr5:146463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B21,C15
`Chr5:146491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:146531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:146544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:146597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B35,B38,B39,B98
`Chr5:146691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C32,C68,C78
`Chr5:146692`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B89,C31
`Chr5:146692`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B89,C31
`Chr5:146702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B4,C56
`Chr5:146709`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A15,A20,B105,B117,B133,B136,B29,B34,B56,B70,B81,B86,B94,B96,C32,C52,C63,C68,C78,C79,C81
`Chr5:146725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B27,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810233.1

281 aa

140

281

DUF761

PF05553 DUF761 245-279 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810233.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	245	279	2.6e-10	40.4	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954250.1
ATGGCTTATTTGTCAGATTCCAACATAAGCATGGCAGTGAAGGCGTTGAAGCTGCTATTTTTTTCAGCAGGTTTGCTTTCCACTGCGGTGATGGTGAAAGAGGCATTTGTGCCCTTTTTGTGTGAGATTTTTTTCCCCAATCTCGTAGCGTTTTGGAATTCATTTAGGTGTTTCTTGTCTTCCCCTCTCTACATCTGCATCATCATCAACTCCGTGGTGCTGCTCATCGCCGCCACCTCGAGCTCCCACCGCCACGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024710
ATGGCTTATTTGTCAGATTCCAACATAAGCATGGCAGTGAAGGCGTTGAAGCTGCTATTTTTTTCAGCAGGTTTGCTTTCCACTGCGGTGATGGTGAAAGAGGCATTTGTGCCCTTTTTGTGTGAGATTTTTTTCCCCAATCTCGTAGCGTTTTGGAATTCATTTAGGTGTTTCTTGTCTTCCCCTCTCTACATCTGCATCATCATCAACTCCGTGGTGCTGCTCATCGCCGCCACCTCGAGCTCCCACCGCCACGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810233.1
MAYLSDSNISMAVKALKLLFFSAGLLSTAVMVKEAFVPFLCEIFFPNLVAFWNSFRCFLSSPLYICIIINSVVLLIAATSSSHRHDDDPPPPPEATTLCSDEQTLYHGSVIGDDCAPLATSDVNDDVVDDVVEIEAPESLSDHISDYDHERDIEKRDTVDSNSEPSLSRGDHEREAEGDDTMDSTWQTIVEGRSKKLTKSESVPPRSRVEEHQHRKELRKLETFNDGASIRRLGGLRRDPSLDVDEFNRQVEAFINKFNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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