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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000030`

染色体: Chr05 坐标: 148266-151780 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000030`
名称	SmilChr05G000030
描述	dehydrogenase/reductase SDR family member FEY-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	148266 - 151780 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026517`
GeneID	`131026517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026517`
原始查询	`SmilChr05G000030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydrogenase/reductase SDR family member FEY-like
产物	dehydrogenase/reductase SDR family member FEY-like
Arabidopsis	`AT4G27760` (FEY) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828890] identity=72; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0116500` - identity=73; qcov=0.879; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057812376.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057812376.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057812376.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812376.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:148403`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	209	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr5:148410`	`CA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B124,B6,C22
`Chr5:148434`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A18,A21,A3,B124,B130,B23,B24,B33,B40,B55,B67,B74,C24,C32,C41,C47,C68,C70,C84,D7
`Chr5:148439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:148445`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A10,A13,B10,B102,B112,B114,B127,B131,B132,B134,B135,B138,B15,B17,B37,B45,B54,B59,B64,B72,B87,B88,B99,C1,C13,C15,C18,C24,C25,C3,C38,C48,C5,C53,C77,D1,D5,D9
`Chr5:148467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:148474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C43,D8
`Chr5:148487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B139,B51,B79,C46
`Chr5:148538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:148554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B25,C26,C35,C83
`Chr5:148605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B16,B8,C22
`Chr5:148631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B59,B89,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812376.1

405 aa

202

405

adh_short

adh_short_C2

adh_short

PF08659 KR 89-199 aa PF00106 adh_short 91-232 aa PF13561 adh_short_C2 96-301 aa PF00106 adh_short 245-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812376.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	89	199	9.5e-09	36.1	KR domain
`XP_057812376.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	91	232	2.2e-33	116.1	short chain dehydrogenase
`XP_057812376.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	96	301	8.1e-19	68.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057812376.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	245	299	2.2e-33	116.1	short chain dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956393.1
GTAATACAACAAAAATCAACCGAATCTATCAGCCTAAACAAATCAACGGTCACGATTTCATCATGAAAACTAATCGGACGGCCCAAACACACTCACAGATACAGTACTCTTTGAGCTGTTTCTATGGAATCTCCAAACTATATACATACAAACTTCAATTGCATAGCGCAGAGCTCGAGTGAGTGTGTGAAAATGGCGTCGCTTTCATCTCCATCGGAGAAGGGAGCTGAGAACGGAAAACCAGCGGCGCAGAAGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026517
ATGGAATCTCCAAACTATATACATACAAACTTCAATTGCATAGCGCAGAGCTCGAGTGAGTGTGTGAAAATGGCGTCGCTTTCATCTCCATCGGAGAAGGGAGCTGAGAACGGAAAACCAGCGGCGCAGAAGGTGAAGAAGGAGGGATTGGGGTGGATTGAGTGGCTGATGGGGTGGTTCTACCTCGCCTACGAGATGCTGTTTCAGAGAATCGTCGCCAGCAACGTTCCGAATCCAATGCCCCTGCCGCCGATTAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812376.1
MESPNYIHTNFNCIAQSSSECVKMASLSSPSEKGAENGKPAAQKVKKEGLGWIEWLMGWFYLAYEMLFQRIVASNVPNPMPLPPINDLTFIVTGSTSGIGKEIARQLAEAGGHVVMAVRNTKAANELIKRWQENWSGKGLPLNIEVMELDLLSLESVARFAEAWNARSGPLHALINNAGIFSIGEPQKFSRDGYEEHMQVNHLAPALLSVLLLPSLIRSSPSRIVNVNSVMHNLGFVDPEDMNVTSGKRKFTSMVGYSSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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