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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000040`

染色体: Chr05 坐标: 188773-195790 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000040`
名称	SmilChr05G000040
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	188773 - 195790 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026528`
GeneID	`131026528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026528`
原始查询	`SmilChr05G000040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic
产物	probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G17700` (CNBT1) cyclic nucleotide-binding transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821037] identity=60.6; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0773400` (OsCNGC4) - identity=59.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005216 (monoatomic ion channel activity); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057812390.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812390.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812390.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812390.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:189250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B63,D10
`Chr5:189260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:189266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B63,D10
`Chr5:189761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:189801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B140,B18,B51,D10
`Chr5:189807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D10
`Chr5:189810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:189814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B18,D10
`Chr5:189860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr5:189860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:190040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C81
`Chr5:190139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B42,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812390.1

769 aa

384

769

Ion_trans

PF00520 Ion_trans 202-525 aa

XP_057812391.1

769 aa

384

769

Ion_trans

PF00520 Ion_trans 202-525 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812390.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	202	525	3.3e-17	63.2	Ion transport protein
`XP_057812391.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	202	525	3.3e-17	63.2	Ion transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956407.1
ATGAGAGAGAGAAGACGACAAGAGAAGCAACATGGTAGACTACGCCAATCAGCGGCACTTCGTTAGCAGTCGGCACTGCGCTACGAATTTCTCAAAGGAGGCTGCCGCCAATCTTCCGCATCGCAACAACCAAAAATGGGCTTCCATTTTGGCCTCCATCGCCACCGCCAACACAAACACACACACGCACGGCTGTGTGCGTTTCTTGCTCTGTCCCTACGAGTACGACTTGGCCAACTTGGTTGTCGTTGCTTTTCTGG...

XM_057956408.1
GTTAGCAGTCGGCACTGCGCTACGAATTTCTCAAAGGAGGCTGCCGCCAATCTTCCGCATCGCAACAACCAAAAATGGGCTTCCATTTTGGCCTCCATCGCCACCGCCAACACAAACACACACACGCACGGCTGTGTGCGTTTCTTGCTCTGTCCCTACGAGTACGACTTGGCCAACTTGGTTGGTACGTCTCTTGCTTTACGGTCGTTGCTTTTCTGGGAGTGCTTAAAGATTGGTTTTTTATTTATATGGTGAGCTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026528
ATGAGTGCTTCTGAAAGAGATGAGATACCTATGCTACCAATTGCAAGCTTAAAGTCGGATGCTGGGGATGACTCCGGAAGTAGAGGCTTGTCAACCAGAACGAGGAGTGCATCGATGTCCATCCCTTCAAACTCCATGGATTCTACAGAATACGAGCCAAGTCTTGTGGGTTTCACCGGTCCTTTGAGAAATGCAAGACGAGGTCCTGACACGCAGATGAGCGGCCCTTTATATGCAAACCGCAACCAGGAGTTTGTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812390.1
MSASERDEIPMLPIASLKSDAGDDSGSRGLSTRTRSASMSIPSNSMDSTEYEPSLVGFTGPLRNARRGPDTQMSGPLYANRNQEFVFQPPKGALRQKATEPKVDRTEKIGWPAEDYMGKNEHLLRSGQLGMCNDPYCTTCPMYYNVKGRPKPSRTTEIFDAKFHNMLHGDGKGWAKRMWSFLFPYIPGVMNPHTLFVQRWNQFFVIACSFAVFLDPMFFFLLTVQKESKCIILNGPMTTALVVLRSMTDFIYLLHILLQF...

XP_057812391.1
MSASERDEIPMLPIASLKSDAGDDSGSRGLSTRTRSASMSIPSNSMDSTEYEPSLVGFTGPLRNARRGPDTQMSGPLYANRNQEFVFQPPKGALRQKATEPKVDRTEKIGWPAEDYMGKNEHLLRSGQLGMCNDPYCTTCPMYYNVKGRPKPSRTTEIFDAKFHNMLHGDGKGWAKRMWSFLFPYIPGVMNPHTLFVQRWNQFFVIACSFAVFLDPMFFFLLTVQKESKCIILNGPMTTALVVLRSMTDFIYLLHILLQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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