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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000044`

染色体: Chr05 坐标: 213308-216816 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000044`
名称	SmilChr05G000044
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	213308 - 216816 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026532`
GeneID	`131026532`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026532`
原始查询	`SmilChr05G000044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.4; qcov=0.998; evalue=5.19e-32; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=26.6; qcov=0.758; evalue=8.46e-35; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026532

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812397.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812397.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812397.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812397.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:214478`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B129,B56,C42
`Chr5:214478`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B129,B56,C42
`Chr5:214482`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B129,B56,C42
`Chr5:214482`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B129,B56,C42
`Chr5:214494`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B132,B22,C41,C63
`Chr5:214494`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B132,B22,C41,C63
`Chr5:214557`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B107,B24
`Chr5:214557`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B107,B24
`Chr5:214561`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A16,B115,B119,B36,B56,B65,B78,B81,B91,B93,B96,C37,C43,C49,C50,C58,C72
`Chr5:214570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B26,B89,B99,C87
`Chr5:214605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C67
`Chr5:214607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812397.1

565 aa

282

565

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 161-325 aa

XP_057812398.1

565 aa

282

565

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 161-325 aa

XP_057812399.1

565 aa

282

565

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 161-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812397.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	325	5.5e-30	104.9	NB-ARC domain
`XP_057812398.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	325	5.5e-30	104.9	NB-ARC domain
`XP_057812399.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	325	5.5e-30	104.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956414.1
GCAGCGCCGCCTATTCCCTTTCTTCATTCATCTTATTCCGACAACCTCGTCACCACCGAACAAAACCAAGCTGCTGCCGCGCAGACTCGCTCCAATCTCCTCTCATAGAGTTACAGTTGAGATCTAAATTTGCCCACAATCGTATTCTCAGCTACTCTGGCTTGAAAATTTCGCTATGGCGGCTTATGGTGCGGCGGCTTCTCTCAGGAATACGATTGAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACT...

XM_057956416.1
CCGCCTATTCCCTTTCTTCATTCATCTTATTCCGACAACCTCGTCACCACCGAACAAAACCAAGCTGCTGCCGCGCAGACTCGCTCCAATCTCCTCTCATAGACCCACAATCGTATTCTCAGCTACTCTGGCTTGAAAATTTCGCTATGGCGGCTTATGGTGCGGCGGCTTCTCTCAGGAATACGATTGAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAACCTGCCTACGAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131026532
ATGGCGGCTTATGGTGCGGCGGCTTCTCTCAGGAATACGATTGAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACAACCTGCCTACGATGAGATGGATCGATTGCAGAAAGTTCTGCTAAAATTGGATGACACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTGTGGATGAACGAATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTTGAAGATTTACTCGAATCCCATGTCTTACATCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057812397.1
MAAYGAAASLRNTIERILQSSRISLVSHSPQILQPAYDEMDRLQKVLLKLDDTSCSKIRTKVNAVDERIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLESSIGPLSFFIDLQSLQHHVDCFAMTVKMMKVEYTKEMKNMAEEEGLPISSRIDFGGIKSKMVGFSRYFEKARDYLLQENNYEPYSIIGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIRSHFELRAWVKVGRKCESDELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDEELVGLLTDRLKDKKCLI...

XP_057812398.1
MAAYGAAASLRNTIERILQSSRISLVSHSPQILQPAYDEMDRLQKVLLKLDDTSCSKIRTKVNAVDERIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLESSIGPLSFFIDLQSLQHHVDCFAMTVKMMKVEYTKEMKNMAEEEGLPISSRIDFGGIKSKMVGFSRYFEKARDYLLQENNYEPYSIIGMAGVGKTTLAKHIFEDPSIRSHFELRAWVKVGRKCESDELLRCILAQVDPNAYQMLTQGDDEELVGLLTDRLKDKKCLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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