当前解析结果
SmilChr05G000051| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000051 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000051 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G000051 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 237566 - 239845 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024715 |
|---|---|
| GeneID | 131024715 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024715 |
| 原始查询 | SmilChr05G000051 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=29.5; qcov=0.143; evalue=1.46e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024715 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057810237.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057810237.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057810237.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810237.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810237.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:237571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,B89 |
Chr5:237576 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B113,D8 |
Chr5:237592 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C40 |
Chr5:237620 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,C87 |
Chr5:237621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,A3,B102,B86,B94 |
Chr5:237622 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr5:237629 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,B88,D3 |
Chr5:237634 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B109,B119,B13 |
Chr5:237641 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C36 |
Chr5:237649 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B136,B88,D3 |
Chr5:237661 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr5:237668 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B78,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。