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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000061`

染色体: Chr05 坐标: 288463-291452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000061`
名称	SmilChr05G000061
描述	protein TIFY 6B-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	288463 - 291452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026544`
GeneID	`131026544`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026544`
原始查询	`SmilChr05G000061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIFY 6B-like
产物	protein TIFY 6B-like
Arabidopsis	`AT3G17860` (JAZ3) jasmonate-zim-domain protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821055] identity=33.9; qcov=1.03; evalue=1.41e-31; confidence=low
Rice	`Os08g0428400` (OsJAZ9) - identity=35.1; qcov=0.662; evalue=3.06e-15; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0009611 (response to wounding); GO:0031347 (regulation of defense response); GO:2000022 (regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06200 (tify); PF09425 (Jas_motif)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026544

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812415.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812415.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812415.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812415.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:288913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr5:288969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:288976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr5:289002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C14
`Chr5:289546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B63,C42,C61
`Chr5:289562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr5:289566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C30,C54,C60
`Chr5:289626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:289681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:289688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:289932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:289934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812415.1

314 aa

157

314

tify

Jas_motif

PF06200 tify 135-166 aa PF09425 Jas_motif 270-294 aa

XP_057812416.1

314 aa

157

314

tify

Jas_motif

PF06200 tify 135-166 aa PF09425 Jas_motif 270-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812415.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	135	166	5.4e-19	67.9	tify domain
`XP_057812415.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	270	294	4.7e-11	43.0	Jas motif
`XP_057812416.1`	Pfam	`PF06200`	tify	Domain	135	166	5.4e-19	67.9	tify domain
`XP_057812416.1`	Pfam	`PF09425`	Jas_motif	Motif	270	294	4.7e-11	43.0	Jas motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956432.1
TCGCTTGGTAACATTGATAACTACAATAATGTTATCTTAATGCACATGAGAAACTTACAAATACAATTCAATATTTTCAAAAGATTATTCAATTACCCTTTCACCCTCTTTTATAGCTACTGCAGGGCGGCATTTTGATGTATTTAATATTCAAATTTGCATAGTATTATAATTGTCACTGATTCACATTAGAAAAATAAAACAAATTTTTATTATGATTGTCATTCAAGTTTCTGAATCTAGACTCCACCTAATTCTTG...

XM_057956433.1
CTTGGTAACATTGATAACTACAATAATGTTATCTTAATGCACATGAGAAACTTACAAATACAATTCAATATTTTCAAAAGATTATTCAATTACCCTTTCACCCTCTTTTATAGCTACTGCAGGGCGGCATTTTGATCTCAATTAAGAAGTGCAGCAATGGAGTGGCGATTGCCAAACAAGAGCTTTGCTCAACCTCAGCTCTTGTCCTTCCATGGCTCTCATGGAGAGAAGGCGAAGACCGGCTTCGACTCCCTCGCCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026544
ATGGAGTGGCGATTGCCAAACAAGAGCTTTGCTCAACCTCAGCTCTTGTCCTTCCATGGCTCTCATGGAGAGAAGGCGAAGACCGGCTTCGACTCCCTCGCCTCAGCCGGTCTGGTGACGATAACCACCACGGAAATTGACACGGATCGGAGTTCTTACTCGGCCGTTATGCAGAAAAACATTGATCAAGGAGGAGTTCGGTACACGGTCACAACCTATCCCGCCGATCCAAGGAGTGCGACGGCCTTGCCGGCAATGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812415.1
MEWRLPNKSFAQPQLLSFHGSHGEKAKTGFDSLASAGLVTITTTEIDTDRSSYSAVMQKNIDQGGVRYTVTTYPADPRSATALPAMGASVHQSFVPLSPQPISAIPMVNPIPAMSLSSPVVGTTDLRNSSKSSGTPAQLTIFYNGSVCVYDNVSADKAQAIMLLAGNGPPVASSAPVPAAPVQASAPRPSILESYVVNHPYGGGASHRLSPAAKATGGVSQSMGWAGAISEMNASKQGGVLVSSSKVEPLRVVSSPAPVS...

XP_057812416.1
MEWRLPNKSFAQPQLLSFHGSHGEKAKTGFDSLASAGLVTITTTEIDTDRSSYSAVMQKNIDQGGVRYTVTTYPADPRSATALPAMGASVHQSFVPLSPQPISAIPMVNPIPAMSLSSPVVGTTDLRNSSKSSGTPAQLTIFYNGSVCVYDNVSADKAQAIMLLAGNGPPVASSAPVPAAPVQASAPRPSILESYVVNHPYGGGASHRLSPAAKATGGVSQSMGWAGAISEMNASKQGGVLVSSSKVEPLRVVSSPAPVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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