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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000066`

染色体: Chr05 坐标: 323560-324629 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000066`
名称	SmilChr05G000066
描述	mannose-specific lectin alpha chain-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	323560 - 324629 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026550`
GeneID	`131026550`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026550`
原始查询	`SmilChr05G000066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannose-specific lectin alpha chain-like
产物	mannose-specific lectin alpha chain-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=31.3; qcov=0.88; evalue=7.21e-21; confidence=low
Rice	`Os08g0124500` - identity=32; qcov=0.917; evalue=5.26e-30; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026550

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812422.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057812422.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812422.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812422.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:323698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C46
`Chr5:323743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr5:323829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B74,B98
`Chr5:323838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B67,C33
`Chr5:323924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr5:323990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr5:324001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B36,C48
`Chr5:324040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C75
`Chr5:324072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B65,C49,C50,C8
`Chr5:324097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:324105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr5:324121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,C16,C29,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812422.1

276 aa

138

276

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 31-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812422.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	31	258	1.3e-45	156.6	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956439.1
GCGTAATGAATGATTGATGTGCCATTATTATCATGCATGCACTATACACTATTAATAGATGCAAGAGATGCCACTAGTATCCACCACATCCAAATCAAATACTCTTACTCAATTAAGCCATGGCCAAGCTTCTTCAAACCCTAATTCCTCTCTTCTCCTCCATCGTCCTCCTCCTCGCCACGGCTGCCAAAATGGGGCGGTCCCAATCGACGTCCTTCACCTACGACTTCTGGGGCGACCAACCGACCGAGCTCCTCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026550
ATGGCCAAGCTTCTTCAAACCCTAATTCCTCTCTTCTCCTCCATCGTCCTCCTCCTCGCCACGGCTGCCAAAATGGGGCGGTCCCAATCGACGTCCTTCACCTACGACTTCTGGGGCGACCAACCGACCGAGCTCCTCTACCAAGGCGACGCCAATTTCCCGTCAGACTCCACCTTCCTCCGCCTGACCAAGACCACCGCCTCCGGCAGCGCGGTCGGGTTTAGCATCGGCCGGCTCGTGTACCCGACACCGGTCACGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812422.1
MAKLLQTLIPLFSSIVLLLATAAKMGRSQSTSFTYDFWGDQPTELLYQGDANFPSDSTFLRLTKTTASGSAVGFSIGRLVYPTPVTFWEAGAQVDFVSTLNFLISPNAGDTNPADGLTFFIAPVGLPLGFTGGCFGIFNSSGIGPSVFAVEFDIFSNAGVDPSYRHIGIDIETRVSKNVTDVGDALLGQRVTAIISYKEATKLISVCVAAGSQKYEVSYVYDLSAILPQQVQVGISAGTGGAVAVHDLVSWSFTSTPVHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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