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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000072`

染色体: Chr05 坐标: 362702-363514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000072`
名称	SmilChr05G000072
描述	agglutinin-2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	362702 - 363514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024722`
GeneID	`131024722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024722`
原始查询	`SmilChr05G000072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	agglutinin-2-like
产物	agglutinin-2-like
Arabidopsis	`AT5G10530` (AT5G10530) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=30.5; qcov=0.97; evalue=3.26e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0779300` - identity=35.1; qcov=0.907; evalue=3.61e-30; confidence=medium
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057810242.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057810242.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810242.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810242.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:362728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B12,B20,C10
`Chr5:362729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B22,C25,C75,C9
`Chr5:362750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:362770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C82
`Chr5:362791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr5:362894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B74,C11,C69
`Chr5:362897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B27,B33,B41,C60
`Chr5:362929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr5:362945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr5:363011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:363038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C28
`Chr5:363091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810242.1

270 aa

135

270

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 30-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810242.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	30	266	2.7e-50	172.0	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954259.1
ATGGCCAAGCTTCTACAAACCCTAATTCTTCTCCTCTTTTGCATAGCATTTTTCCTAATGCTAGCAAACAAGGCAACCTCACAAAAGACCTCCTTCACCTTCACCTCCTTCGTCGCCAACTCCACCGACCTAACCTACCAGGGCGACGCCCACGTCCCCGATGGCGCCCGTTCCCTCCGGCTAACCAAAACCGACGCCAACGGCCTCCCACGGCCGTCGAGCATCGGCCGCGTGTTGTACTCCAAACCCTTCAAATTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024722
ATGGCCAAGCTTCTACAAACCCTAATTCTTCTCCTCTTTTGCATAGCATTTTTCCTAATGCTAGCAAACAAGGCAACCTCACAAAAGACCTCCTTCACCTTCACCTCCTTCGTCGCCAACTCCACCGACCTAACCTACCAGGGCGACGCCCACGTCCCCGATGGCGCCCGTTCCCTCCGGCTAACCAAAACCGACGCCAACGGCCTCCCACGGCCGTCGAGCATCGGCCGCGTGTTGTACTCCAAACCCTTCAAATTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810242.1
MAKLLQTLILLLFCIAFFLMLANKATSQKTSFTFTSFVANSTDLTYQGDAHVPDGARSLRLTKTDANGLPRPSSIGRVLYSKPFKLWENSIVVSFNTTIKFTITPTKGPAADGLAFFMAPVGTTIPPGSYGGNLGLFDPSGDSPAASTFFAVEFDLYSNGWDPSHDLPHIGIDISSIKSSNFVKFGDSCIGKEAQLHIQYDGINFIDVTLKCDKETRLLEYEYDLGEILPSQVQVGIASSTGDLVALHDIDYWSFRSAEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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