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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000075`

染色体: Chr05 坐标: 378227-380991 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000075`
名称	SmilChr05G000075
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	378227 - 380991 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026556`
GeneID	`131026556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026556`
原始查询	`SmilChr05G000075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=40.5; qcov=0.943; evalue=2.43e-114; confidence=medium
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812429.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057812429.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057812429.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812429.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:378439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,A23
`Chr5:378548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B56,B96,C8
`Chr5:378619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr5:378622`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B32
`Chr5:378622`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B32
`Chr5:378641`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B63
`Chr5:378641`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B63
`Chr5:378656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B12,B62,C70,D8
`Chr5:378721`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A6
`Chr5:378721`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A6
`Chr5:378746`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A15,B120,B123,B33,B72,C16,C2,C27,C40,C47,D1,D2,D3
`Chr5:378748`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A15,B120,B123,B33,B72,C16,C2,C27,C40,C47,D1,D2,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812429.1

576 aa

288

576

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 158-366 aa PF12142 PPO1_DWL 384-430 aa PF12143 PPO1_KFDV 453-570 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812429.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	158	366	1.2e-32	114.7	Common central domain of tyrosinase
`XP_057812429.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	384	430	9.4e-19	67.6	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057812429.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	453	570	3e-30	105.7	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956446.1
ATGCCTCCACAGGTAATCACAACGACCATCAATCAATCACTCAAACATGGCTTCCCTTCAATCTTCATTCACGGCGGTCGCCGCCACCACCAACTCCCCATTTCGCAAACCCTCCCAGCTCGGCAGCCGGCGGAGCCACGGCCGCTTTCAGGTGTCATGCAGCAGCGGTGGCGGTGGCAGCGGCCGTATAGACCGCAGAAACATGCTGCTTGGGCTTGGCGGTCTATACGGCGCAGGCAGCGCTATCCGCAAAGCTGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026556
ATGGCTTCCCTTCAATCTTCATTCACGGCGGTCGCCGCCACCACCAACTCCCCATTTCGCAAACCCTCCCAGCTCGGCAGCCGGCGGAGCCACGGCCGCTTTCAGGTGTCATGCAGCAGCGGTGGCGGTGGCAGCGGCCGTATAGACCGCAGAAACATGCTGCTTGGGCTTGGCGGTCTATACGGCGCAGGCAGCGCTATCCGCAAAGCTGAGGCGCTTCCGATTTTGCCTCCTGACCTGAGCACGTGCGACCCCGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812429.1
MASLQSSFTAVAATTNSPFRKPSQLGSRRSHGRFQVSCSSGGGGSGRIDRRNMLLGLGGLYGAGSAIRKAEALPILPPDLSTCDPEGAYTTRNQEVISLDVNCCPPYTDVQSDYKLPRFTKPRVRPAAHRLTPEYVRKYELAIRKMKELDVTDPDDPRGFTQQANIHCAYCNGPYDQVDHPGIDIQVHNSWIFFPFHRWYLYFFERIMGELIGDPDFALPYWNWDNPRGMQMPRPFDREESPLYDVNRDPTHRPPALVAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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