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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000088`

染色体: Chr05 坐标: 491714-494629 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000088`
名称	SmilChr05G000088
描述	caffeoyl-CoA O-methyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	491714 - 494629 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026567`
GeneID	`131026567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026567`
原始查询	`SmilChr05G000088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoyl-CoA O-methyltransferase 2-like
产物	caffeoyl-CoA O-methyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT4G26220` (AT4G26220) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828728] identity=61; qcov=0.461; evalue=1.03e-11; confidence=low
Rice	`Os06g0165800` (ROMT-16) - identity=59.5; qcov=0.416; evalue=2.56e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812436.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812436.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812436.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812436.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:492704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A21,A24,B122,B60
`Chr5:492706`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A3,B139,B47,B82,C13,C60,C61,D7
`Chr5:492858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B22
`Chr5:492884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:492896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr5:493832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:494425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B56,B72,C40,C50
`Chr5:494441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102342.1
CCGCCGCGACTTGCCACCTGCCCCCGCCGCATCCTTGCTTCATCTACCACCCACCGCGGCCCGCCACCCCTCATTTGTGATAAAGCCATAAATCAAATCTTAATTCAAATTTGAGTTCAATCAAACTCGTCACTCCCCGTCGCTGCTCTGTTCTGTGGCTCTCGAAGTCGCCGGCCGCCGCTGTCCAGACCTCCCCCCCAATGATTCTCGTATCTCTCTCACTCTTCCTGGCGCAGCAAATCAGCTCCACTCTTCCCCGA...

XM_057956453.1
CCGCCGCGACTTGCCACCTGCCCCCGCCGCATCCTTGCTTCATCTACCACCCACCGCGGCCCGCCACCCCTCATTTGTGATAAAGCCATAAATCAAATCTTAATTCAAATTTGAGTTCAATCAAACTCGTCACTCCCCGTCGCTGCTCTGTTCTGTGGCTCTCGAAGTCGCCGGCCGCCGCTGTCCAGACCTCCCCCCCAATGATTCTCGTATCTCTCTCACTCTTCCTGGCGCAGCAAATCAGCTCCACTCTTCCCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131026567
ATGGAGACCAAAGCTGTGATCAATACTAGTTCTACAGAAAAAGGCGTGTTGCAAACCGCAGAGTTGTACAAGTATATAATGGATACTAGTGTGTATCCACGCGAACAAGAATGTCTCAAGGAGCTCAGAGCTATCACTTCTACTCATCCAAGGACGAGGCTGATTATATTGCAACCTGAATTCATGGTTTGTGGTGGATTAAATGAGTCGTACGTTGAGCTGAAGAGGCTTGTGAATTCACAAGAAAAGTTGTACCATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057812436.1
METKAVINTSSTEKGVLQTAELYKYIMDTSVYPREQECLKELRAITSTHPRTRLIILQPEFMVCGGLNESYVELKRLVNSQEKLYHMAS

XP_057812437.1
METKAVINTSSTEKGVLQTAELYKYIMDTSVYPREQECLKELRAITSTHPRTRLIILQPEFMVCGGLNESYVELKRLVNSQEKLYHMAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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