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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000093`

染色体: Chr05 坐标: 536792-539179 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000093`
名称	SmilChr05G000093
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	536792 - 539179 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026571`
GeneID	`131026571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026571`
原始查询	`SmilChr05G000093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyphenol oxidase I, chloroplastic-like
产物	polyphenol oxidase I%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0624500` (Ph=Bhc(Po)) - identity=38.6; qcov=1.01; evalue=5.83e-116; confidence=medium
GO	GO:0004097 (catechol oxidase activity); GO:0046148 (pigment biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00264 (Tyrosinase); PF12142 (PPO1_DWL); PF12143 (PPO1_KFDV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057812441.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057812441.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057812441.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812441.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812441.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:536979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,C53,C56,D6
`Chr5:537018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,C53,C56,D6
`Chr5:537021`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B8,C53,C56,D6
`Chr5:537021`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B8,C53,C56,D6
`Chr5:537058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B132,B64
`Chr5:537075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,C11,C45,C69
`Chr5:537194`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,A25,B132,B136,B15,B37,B59,B72,C1,C28,C37,C38
`Chr5:537206`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A14,A18,A2,A7,A9,B106,B119,B12,B123,B124,B128,B13,B132,B137,B139,B21,B23,B24,B26,B33,B36,B4,B45,B48,B5,B55,B65,B73,B76,B8,B84,B85,B86,B93,B94,B97,B98,C15,C19,C22,C23,C26,C29,C30,C34,C43,C49,C5,C50,C61,C8,C82,D2,D4,D8
`Chr5:537235`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A10,A3,B10,B110,B120,B129,B130,B133,B19,B53,B83,B87,B89,C10,C21,C34,C41,C54,C59,C74,C83
`Chr5:537237`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	87	A10,A13,A16,A18,A2,A25,A3,A7,A8,A9,B10,B106,B110,B111,B119,B12,B123,B124,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B136,B137,B139,B15,B19,B21,B23,B24,B26,B30,B33,B36,B37,B4,B45,B48,B5,B53,B55,B59,B65,B72,B73,B76,B8,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B93,B94,B97,B98,C1,C10,C15,C19,C21,C22,C23,C26,C28,C29,C30,C34,C37,C38,C41,C43,C49,C5,C50,C59,C61,C74,C82,C83,D2,D4,D8
`Chr5:537242`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	70	A13,A16,A18,A2,A25,A7,A8,A9,B106,B111,B119,B12,B123,B124,B128,B13,B132,B136,B137,B139,B15,B21,B23,B24,B26,B30,B33,B36,B37,B4,B45,B48,B5,B55,B59,B65,B72,B73,B76,B8,B81,B84,B85,B86,B87,B93,B94,B97,B98,C1,C15,C19,C22,C23,C26,C28,C29,C30,C34,C37,C38,C43,C49,C5,C50,C61,C82,D2,D4,D8
`Chr5:537246`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	71	A13,A16,A18,A2,A25,A7,A8,A9,B106,B111,B119,B12,B123,B124,B128,B13,B132,B136,B137,B139,B15,B21,B23,B24,B26,B30,B33,B36,B37,B4,B45,B48,B5,B55,B59,B65,B72,B73,B76,B8,B81,B84,B85,B86,B87,B93,B94,B97,B98,C1,C15,C19,C22,C23,C26,C28,C29,C30,C34,C37,C38,C43,C49,C5,C50,C59,C61,C82,D2,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812441.1

573 aa

286

573

Tyrosinase

PPO1_DWL

PPO1_KFDV

PF00264 Tyrosinase 155-363 aa PF12142 PPO1_DWL 381-428 aa PF12143 PPO1_KFDV 450-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812441.1`	Pfam	`PF00264`	Tyrosinase	Domain	155	363	2.2e-33	117.1	Common central domain of tyrosinase
`XP_057812441.1`	Pfam	`PF12142`	PPO1_DWL	Domain	381	428	1e-19	70.7	Polyphenol oxidase middle domain
`XP_057812441.1`	Pfam	`PF12143`	PPO1_KFDV	Domain	450	567	7.5e-28	97.9	Chloroplastic Polyphenol Oxidase C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956458.1
TTAATTTTCTATTTCGTTCGTCCACAAAATATCTTCCCCGAAATCATTAACTATCATCACTTTTCTTAAAATTCGTCTCCGCGCCTACTATATATAGACATGCATGCCTCGAGAGCAATGCAAGCATCAATCAATCAAGCATGGCTTCCCTTCAATCTTCATTCATGGTGGTGGCAACCACCAGCAACCCCAACCTCCGCACCTCCTCCCAGCTCGCCAGCAGGCCGAGGCGCCGCTTTGAGGTGTCGTGCAGCAGTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026571
ATGGCTTCCCTTCAATCTTCATTCATGGTGGTGGCAACCACCAGCAACCCCAACCTCCGCACCTCCTCCCAGCTCGCCAGCAGGCCGAGGCGCCGCTTTGAGGTGTCGTGCAGCAGTGACGGCGGCCGTGTAGACCGCAGAAACATGCTGTTTGGACTGGGCGGTCTGTACGGCGCAAGCGGCCTCATCCGCAAAGCTGAGGCGCTTCCGATTTCACCTCCTGACCTGAGCAAGTGCGACCCCAAAGGTGCCTATACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812441.1
MASLQSSFMVVATTSNPNLRTSSQLASRPRRRFEVSCSSDGGRVDRRNMLFGLGGLYGASGLIRKAEALPISPPDLSKCDPKGAYTVKNEEKKDLPDNCCPPYSDTKKGYYELPTFTEMRRRPAAHNLTPDYIKKYENAIQEMRKLDVTDPDDPRGFLQQANIHCAYCNGPYDQVGHPGIDIQVHNSWLFFPFHRWYLYFYERIMGELIGDPNFALPYWNWDNPDGMQMPLMFDREESPLYDIERDQTHRPPAVVSLALS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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