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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000096`

染色体: Chr05 坐标: 574556-575784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000096`
名称	SmilChr05G000096
描述	lectin alpha chain-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	574556 - 575784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026575`
GeneID	`131026575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026575`
原始查询	`SmilChr05G000096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lectin alpha chain-like
产物	lectin alpha chain-like
Arabidopsis	`AT1G53060` (AT1G53060) Legume lectin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841740] identity=27; qcov=0.908; evalue=1.79e-16; confidence=low
Rice	`Os09g0334800` - identity=33.9; qcov=0.93; evalue=3.36e-27; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812446.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812446.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812446.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812446.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:574616`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr5:574616`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr5:574643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B14,B28,C16,C9
`Chr5:574684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr5:574707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr5:574844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B57,C64,C66,C86
`Chr5:574877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A7,B17,B23,B94,C29,C75
`Chr5:575162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:575196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:575264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B29
`Chr5:575306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:575309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812446.1

273 aa

136

273

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 30-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812446.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	30	261	1e-43	150.4	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956463.1
CAAACAATTAGTACTCACTCTCAAATAGTACGTAGTATTTGAAAGCCATGGCTGCTTCTTTCCCCCATACCCTAATTCCTCTTGTTTGTTCCATCACCCTCCTCCTCGCCCTGGCAACCACACCTGGCGATGCGACCTCCTTCTCCTACAACTTCAACCAAAAGCCGGATCCTTTGAACTCCATGAGCCTGCAAGGCGACGCCCACTACCTCAAAGACACCGACGAGATTGGCTTAATCCGTTTGACGAAAACTGACGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026575
ATGGCTGCTTCTTTCCCCCATACCCTAATTCCTCTTGTTTGTTCCATCACCCTCCTCCTCGCCCTGGCAACCACACCTGGCGATGCGACCTCCTTCTCCTACAACTTCAACCAAAAGCCGGATCCTTTGAACTCCATGAGCCTGCAAGGCGACGCCCACTACCTCAAAGACACCGACGAGATTGGCTTAATCCGTTTGACGAAAACTGACGAGTCGGGCAAGGCGCTCAATTACAGTGCCGGGCGAGCCGTGTACTTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812446.1
MAASFPHTLIPLVCSITLLLALATTPGDATSFSYNFNQKPDPLNSMSLQGDAHYLKDTDEIGLIRLTKTDESGKALNYSAGRAVYLVPFKFWGDGMQVDFETTMKFIINPNSGDTDPADGFTFFIEPVDAPMGANGASFGEFNYFGSKRSTFAIEFDIHQDRNDPSYPHVGIDIETIDSVVTMEVGNELIGQVVTARIDYKAATSVISVKVTIGSKTYEVSYVKDLSTVLPQEVQFGFSAATGDRVAVHDLISWEFSTTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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