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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000100`

染色体: Chr05 坐标: 612495-613749 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000100`
名称	SmilChr05G000100
描述	lectin alpha chain-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	612495 - 613749 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026576`
GeneID	`131026576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026576`
原始查询	`SmilChr05G000100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lectin alpha chain-like
产物	lectin alpha chain-like
Arabidopsis	`AT5G65600` (AT5G65600) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836686] identity=35.2; qcov=0.86; evalue=8.65e-23; confidence=medium
Rice	`Os09g0334800` - identity=34.6; qcov=0.962; evalue=6.51e-34; confidence=low
GO	GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00139 (Lectin_legB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057812447.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812447.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812447.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812447.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812447.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:612595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C74
`Chr5:612608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr5:612641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C8
`Chr5:612652`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C1
`Chr5:612652`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C1
`Chr5:612666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B120
`Chr5:612726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:612744`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A2,A22,B105,B106,B107,B113,B130,B138,B25,B56,B65,B74,B80,B94,B96,C36,C40,C5,C56,C7,C70,C71,C80,D9
`Chr5:612783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:612795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A1,A10,A20,A4,A5,B31,B53,B55,B58,B61,B78,B81,B95,C20,C47,C60,C63,C74,C84,D7
`Chr5:613152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:613263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C48,C61,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812447.1

264 aa

132

264

Lectin_legB

PF00139 Lectin_legB 27-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812447.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	27	256	4.6e-51	174.5	Legume lectin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956464.1
AGAGACCACCACCATCCATCCCATCAAACCAAAAACAATATTCTTTCAACATAATTAAGCAATGGCCAAGCTTCTCCAAACCCTAATTCCAATCCTTTTCTCCATCGCCTTGCTCCTCGCCGCAGCGCGCTCACAAACCATCTCCTTCACCTATGATTTCTCCGGCGATCAGCACCCAAAGGACCTAACCTACCAAGGCACCGCCCACTTTTCATCGGACACCACCTACCTCCGCCTCACTGACGCGAAGGCGGCCCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026576
ATGGCCAAGCTTCTCCAAACCCTAATTCCAATCCTTTTCTCCATCGCCTTGCTCCTCGCCGCAGCGCGCTCACAAACCATCTCCTTCACCTATGATTTCTCCGGCGATCAGCACCCAAAGGACCTAACCTACCAAGGCACCGCCCACTTTTCATCGGACACCACCTACCTCCGCCTCACTGACGCGAAGGCGGCCCAAGCCGGCCGAGTCTTGTACTCGAACCCGGTCCAGTTCTGGCAAACCGGGGGCCAGGTCGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812447.1
MAKLLQTLIPILFSIALLLAAARSQTISFTYDFSGDQHPKDLTYQGTAHFSSDTTYLRLTDAKAAQAGRVLYSNPVQFWQTGGQVDFETTINFIITPIEDILPADGITFFVAPVGSTIPAGSTGGNLGIFNSSGTGPTVFAVEFDPYANDHWDSNFRHVGIDLGSRVSSNTTEVGGAITGQQVTARINYEEATKMITVHVIAGTKKFDVSYEFDLGSFLPEKVQVGLSASTGDNVATHDIVSWYFSATMVNMKKNMDAMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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