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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000101`

染色体: Chr05 坐标: 619056-619541 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000101`
名称	SmilChr05G000101
描述	probable small nuclear ribonucleoprotein F
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	619056 - 619541 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026577`
GeneID	`131026577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026577`
原始查询	`SmilChr05G000101`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable small nuclear ribonucleoprotein F
产物	probable small nuclear ribonucleoprotein F
Arabidopsis	`AT4G30220` (RUXF) small nuclear ribonucleoprotein F [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829145] identity=85.2; qcov=1; evalue=1.76e-53; confidence=high
Rice	`Os11g0657300` - identity=90.7; qcov=0.977; evalue=3.13e-54; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812448.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057812448.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812448.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057812448.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812448.1

88 aa

LSM

PF01423 LSM 10-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812448.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	10	73	3.7e-24	84.9	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956465.1
CGACCAAGAAATTCTCTCTCATTCCTGAAACCGCTGCCATGGCTACTGTACCAGTTAACCCAAAGCCTTTCTTGAATAATTTGACTGGGAAGCCTGTCATGGTCAAACTCAAATGGGGAATGGAATACAAAGGTTACCTCGTCTCTGTGGATTCATACATGAACTTGCAGCTTGCAAATGCTGAGGAATACATTGATGGGCAGTGCACTGGAAGCCTCGGAGAAATCTTGATCAGATGCAATAATGTTCTGTATCTTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026577
ATGGCTACTGTACCAGTTAACCCAAAGCCTTTCTTGAATAATTTGACTGGGAAGCCTGTCATGGTCAAACTCAAATGGGGAATGGAATACAAAGGTTACCTCGTCTCTGTGGATTCATACATGAACTTGCAGCTTGCAAATGCTGAGGAATACATTGATGGGCAGTGCACTGGAAGCCTCGGAGAAATCTTGATCAGATGCAATAATGTTCTGTATCTTCGCGGCGTCCCTGAGGATGAAGAGATTGAAGAAGCTGACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812448.1
MATVPVNPKPFLNNLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDSYMNLQLANAEEYIDGQCTGSLGEILIRCNNVLYLRGVPEDEEIEEADRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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