当前解析结果
SmilChr05G000120| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000120 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000120 |
| 描述 | agglutinin-2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 944056 - 944742 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024733 |
|---|---|
| GeneID | 131024733 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024733 |
| 原始查询 | SmilChr05G000120 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | agglutinin-2-like |
| 产物 | agglutinin-2-like |
| Arabidopsis | AT5G10530 (AT5G10530)Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830918] identity=28.7; qcov=1.01; evalue=7.46e-14; confidence=low |
| Rice | Os09g0334800- identity=34.2; qcov=0.987; evalue=9.2e-24; confidence=low |
| GO | GO:0030246 (carbohydrate binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00139 (Lectin_legB) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024733 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057810254.1 |
| 2 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.40000 | XP_057810254.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057810254.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810254.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810254.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810254.1PF00139
Lectin_legB 3-222 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810254.1 |
Pfam | PF00139 |
Lectin_legB | Domain | 3 | 222 | 3e-37 | 129.2 | Legume lectin domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。