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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000124`

染色体: Chr05 坐标: 994000-999360 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000124`
名称	SmilChr05G000124
描述	probable Ufm1-specific protease
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	994000 - 999360 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026614`
GeneID	`131026614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026614`
原始查询	`SmilChr05G000124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable Ufm1-specific protease
产物	probable Ufm1-specific protease
Arabidopsis	`AT3G48380` (AT3G48380) Peptidase C78, ubiquitin fold modifier-specific peptidase 1/ 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823996] identity=60.6; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0285500` - identity=54.9; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07910 (Peptidase_C78); PF20908 (UfSP2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812511.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057812511.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057812511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812511.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:994180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr5:994216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:994228`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr5:994228`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr5:994267`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C38,D10
`Chr5:994267`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C38,D10
`Chr5:994294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:994312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:994330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:994351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B66,B97
`Chr5:994353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:994562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B17,B95,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812511.1

661 aa

330

661

UfSP2_N

Peptidase_C78

PF20908 UfSP2_N 341-426 aa PF07910 Peptidase_C78 463-653 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812511.1`	Pfam	`PF20908`	UfSP2_N	Domain	341	426	7.2e-09	36.5	Ubiquitin-fold modifier 1 specific protease 2, N-terminal
`XP_057812511.1`	Pfam	`PF07910`	Peptidase_C78	Family	463	653	4.7e-67	226.2	Peptidase family C78

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956528.1
TCCGAGTCCAAGCTAAGTAGCAACTGCTTAACTGGTAAAACTGAAAAAATAATTCCTACCCATTTGAGGTAATTCACGGCGACCCCACTCTCAGTGATGGGCGCTCAGAGCTTCGCCGGAATCCGAATCCTTTGCCGGAATCTGTTGCTGTTGAGGAAGGAATCCGGCGTCCAATGGCTGATCGGTTCGCCCTTCTTCCCTTCACCGACCATCGTCTCCTCCATGCGCTGCCTCCACACTCTTCCCTCCAATCCCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026614
ATGGGCGCTCAGAGCTTCGCCGGAATCCGAATCCTTTGCCGGAATCTGTTGCTGTTGAGGAAGGAATCCGGCGTCCAATGGCTGATCGGTTCGCCCTTCTTCCCTTCACCGACCATCGTCTCCTCCATGCGCTGCCTCCACACTCTTCCCTCCAATCCCCTCTCTCCCGACCTGGCTAAGGAATTAGATGATATCAGGAGCCTGATTCCAAGGGGTTTTGAAGTGATCGGAGCATTGATTGTCCGTGATAAGGGTGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812511.1
MGAQSFAGIRILCRNLLLLRKESGVQWLIGSPFFPSPTIVSSMRCLHTLPSNPLSPDLAKELDDIRSLIPRGFEVIGALIVRDKGDMKVEKVAGDAISAVVSFRKALYGNDREDPVLIGAVLDLNIGSSERDLQFFISRTGNSYKLDKVSSVVYEDQPEKEVWENFCIVCCELPLKLPLYYASDNPKAAEGAYAQAITAVERKLRDPQVAYIVEAPNRPSSGGPEPVILHGFELDPAAEELPENAINAVVLESDEESLKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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