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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000132`

染色体: Chr05 坐标: 1076132-1079423 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000132`
名称	SmilChr05G000132
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1076132 - 1079423 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026631`
GeneID	`131026631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026631`
原始查询	`SmilChr05G000132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29.7; qcov=0.732; evalue=6.25e-24; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=34.2; qcov=0.598; evalue=8.05e-29; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812530.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057812530.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812530.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812530.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1076598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B17,B28,B66,C22
`Chr5:1076760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B93,C9,D4
`Chr5:1076790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B54,C46,C80
`Chr5:1076801`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A1,B12,B13,B15,B38,B39,B4,B62,B8,C13,C15,C39,C42,C71
`Chr5:1076804`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,B12,B13,B15,B38,B4,B8,C13,C15,C39,C42,C71
`Chr5:1076822`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B12,B54,B71,B93,C13,C42,C46,C71,C80,C9
`Chr5:1076825`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B54,B93,C46,C80
`Chr5:1076825`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B54,B93,C46,C80
`Chr5:1076829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B5,B90
`Chr5:1076850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B54,C46,C80
`Chr5:1076865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr5:1076900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812530.1

455 aa

228

455

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 199-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812530.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	199	366	8.6e-29	101.0	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956547.1
GCTCAATCTTCGGTTGCTTAGTTTCTCTCTATTCTTCCACACAATTTCCTTCAAAATCATCAATAGATCCATTTTACCATTACATTATACACACATCTTTTCAAATCATTTACTAAAATTCACATTACAATTTTCGTGCACAGAGAGGAAGGGTGCATCATTGCATGTGGTATTGAATGTTTCTGAAATTCTATCAAAATCACTGCTGCAGCCAATCTCATTTATGAGAGGAAATTTCTGCCACAGAATTTTATTCTGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026631
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCGGTTTCTCTGAAGAATACGATTCAGCGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCACCCTCTCCACAAATAGTACCCTCAGCTGATTATGGTGCAGCGACTTTTCTCAAGAATACGATTCAGTGTATTCTACAGTTGTTTTGCATTTTGCCCGCTCCCCCCTCTCCACATATCTTACAACCTGCCTACGACGAGATGGAGCGCTTGCAGAAAGTTCTGCTCAAATTGGACGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812530.1
MAAYGAAVSLKNTIQRILQSSRISLVSPSPQIVPSADYGAATFLKNTIQCILQLFCILPAPPSPHILQPAYDEMERLQKVLLKLDETSCSKIRTKVNAADELIKEAVWEFEDLLESHVLHQILPQLESRSGGERDKLSFSVDLQSLQHHVDCFVEMVKMMEEEYIIEMENMPEEEGEPVSSRIDSGGMIKSKMVGLSDEFQKARDYLLEENNNNNYSIIGMAGIGKTTLAKHIFEDPSIRSHFEFRAWVRVGRKCESNEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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