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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000139`

染色体: Chr05 坐标: 1115565-1123709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000139`
名称	SmilChr05G000139
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1115565 - 1123709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026611`
GeneID	`131026611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026611`
原始查询	`SmilChr05G000139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
产物	probable ubiquitin-like-specific protease 2B
Arabidopsis	`AT4G33620` (AT4G33620) Cysteine proteinases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829502] identity=36.3; qcov=0.782; evalue=7.39e-99; confidence=medium
Rice	`Os05g0207900` - identity=43.4; qcov=0.557; evalue=9.49e-104; confidence=medium
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF25352 (PH_ULP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812506.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812506.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812506.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812506.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1115760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:1115776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B14,B60,D10
`Chr5:1115779`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:1115779`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1115782`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:1115782`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1115862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1115906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C8,C84
`Chr5:1115926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr5:1115976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:1116340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B47,C16
`Chr5:1116347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812506.1

757 aa

378

757

PH_ULP

Peptidase_C48

PF25352 PH_ULP 213-332 aa PF02902 Peptidase_C48 372-565 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812506.1`	Pfam	`PF25352`	PH_ULP	Domain	213	332	7.1e-37	126.8	Ubiquitin-like protease PH domain
`XP_057812506.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	372	565	3e-32	113.0	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956523.1
AACCTTTGGGGTTGCAAGGAAGCTACTATTTCTATATACCTAAAATTTGAATTTTTTTTTTCCCACTGAAACGCACTCAAATTTTCTCTTGGCAAACCGTTCAACTTCCCGGGATAAATTTCCCAATCTATGCCATTTCCGATCACTATGGGGAAGAGAAGAAACGCCGGTAAAAAATCTGACGGTGGCGCCGCCAGCAGCATCAACGACGGTGGTGGCCGGAGCAGCAACAACATTTTCTCAGTCTTTGAATTTACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026611
ATGCCATTTCCGATCACTATGGGGAAGAGAAGAAACGCCGGTAAAAAATCTGACGGTGGCGCCGCCAGCAGCATCAACGACGGTGGTGGCCGGAGCAGCAACAACATTTTCTCAGTCTTTGAATTTACTTCTGATGATTTGCTGGCGGAGGACAAATCAGCCAAAATATGTACCAAATTCGGAGCTAAAAGCCCTAGCAGCAAACCCGTACGCCGTCGTAAATCCGTTGATAAATACGATTTCCTTAAGTGCTTTGCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812506.1
MPFPITMGKRRNAGKKSDGGAASSINDGGGRSSNNIFSVFEFTSDDLLAEDKSAKICTKFGAKSPSSKPVRRRKSVDKYDFLKCFAQGTKSKQKDFGNDELEAAATVSQDKTFGTDVEMSLGSLDYESVSLSSLECQSSECTYGVKSGLGRWRKPGCHTAGKKHTQVWYLDTDDDERLELGSLGSSIKMGENEGSLKGQSSENGANSNDCEAVVVVTPYYVKHEKNYFGRCFLTFSRRCIRLEGSPVCDRKSTLCVEWPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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