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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000140`

染色体: Chr05 坐标: 1124627-1128944 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000140`
名称	SmilChr05G000140
描述	MADS-box protein JOINTLESS-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1124627 - 1128944 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984924`
GeneID	`130984924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984924`
原始查询	`SmilChr05G000140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MADS-box protein JOINTLESS-like
产物	MADS-box protein JOINTLESS-like
Arabidopsis	`AT2G22540` (SVP) K-box region and MADS-box transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816787] identity=43.5; qcov=1.21; evalue=2.75e-53; confidence=medium
Rice	`Os03g0186600` (OsMADS47) - identity=44; qcov=1.09; evalue=1.06e-51; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00319 (SRF-TF); PF01486 (K-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763620.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763620.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763620.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763620.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1125059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B91
`Chr5:1125060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr5:1125410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B98,C14,C8,C84
`Chr5:1125423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr5:1125600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:1126881`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A2,A8,B103,B117,B119,B127,B132,B20,B21,B35,B36,B37,B40,B48,B49,B57,B65,B7,B99,C25,C33,C34,C4,C43,C49,C50,C54,C55,C73,C8,D5
`Chr5:1126895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:1126898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr5:1127374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B66,B97
`Chr5:1127380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B124,C6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763620.1

204 aa

102

204

SRF-TF

K-box

PF00319 SRF-TF 10-57 aa PF01486 K-box 84-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763620.1`	Pfam	`PF00319`	SRF-TF	Domain	10	57	2.2e-24	85.3	SRF-type transcription factor (DNA-binding and dimerisation domain)
`XP_057763620.1`	Pfam	`PF01486`	K-box	Family	84	165	4e-15	56.5	K-box region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907637.1
TATTGAATTATTCCGTTGCTTGTCTCTCACCATTTCTACATATGAATAAATATATCTGAATTTGTAAAAGTTTGAATTTTGGGAAGAAGGGTTTAATTCTGTGTTTTTACCATTTCTAGCCCTCTTTTCTCAAAGCCCCTCTCTCTCTCTCTCTTTAGGAAGATGGTGAGGCAGAAGATTCAGATAAAGAAGATCGATAACTTGACAACGAGGCAGGTGACTTTCTCGAAGAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984924
ATGGTGAGGCAGAAGATTCAGATAAAGAAGATCGATAACTTGACAACGAGGCAGGTGACTTTCTCGAAGAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAAGCTCAAGAGCTCGCCACTCTCTGCGATGCTGAGATTGCTCTCATTGTTTTCTCGGCCACCGGAAAGCTCTTCGACTACTCCAGCTCTAGCATTACGCAAATCATCCAAAGGCTTAACCTGCAATCAGAGGATAGCTATAGCAAGCGCCTCAACAATCTGCAGGCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763620.1
MVRQKIQIKKIDNLTTRQVTFSKRRRGLFKKAQELATLCDAEIALIVFSATGKLFDYSSSSITQIIQRLNLQSEDSYSKRLNNLQAGGDNYDAIINELTLELRQLHGQELQGLDVNELQRLERVVESAMGRVGKKKKNMLMNEISKLKTREIELLEENAMLKQQVDEQGCSVESISNSYGFSEDMSVSDDTALKLGLSISGGDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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