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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000142`

染色体: Chr05 坐标: 1146862-1150361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000142`
名称	SmilChr05G000142
描述	beta carbonic anhydrase 5, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1146862 - 1150361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026655`
GeneID	`131026655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026655`
原始查询	`SmilChr05G000142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta carbonic anhydrase 5, chloroplastic-like
产物	beta carbonic anhydrase 5%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G33580` (BCA5) beta carbonic anhydrase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829498] identity=58.9; qcov=0.992; evalue=2.09e-110; confidence=high
Rice	`Os09g0464000` (OsbetaCA2) - identity=64.1; qcov=0.858; evalue=1.56e-104; confidence=high
GO	GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0015976 (carbon utilization)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00484 (Pro_CA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057812553.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812556.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057812553.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057812556.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1147563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1148335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:1148367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:1148798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B66
`Chr5:1149489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C37
`Chr5:1149612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1149623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,C2,C32,C68
`Chr5:1149633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A21,B124,B40,C84
`Chr5:1149887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812553.1

300 aa

150

300

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 117-270 aa

XP_057812554.1

299 aa

150

299

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 116-269 aa

XP_057812555.1

329 aa

164

329

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 146-299 aa

XP_057812556.1

260 aa

130

260

Pro_CA

PF00484 Pro_CA 77-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812553.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	117	270	2.3e-42	145.6	Carbonic anhydrase
`XP_057812554.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	116	269	2.4e-42	145.5	Carbonic anhydrase
`XP_057812555.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	146	299	3.1e-42	145.2	Carbonic anhydrase
`XP_057812556.1`	Pfam	`PF00484`	Pro_CA	Domain	77	230	1.8e-42	146.0	Carbonic anhydrase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956572.1
AATTTCTATTTTCATTTTAATTCCTAACGAATTTTGGTTTCGGTGGGCCAACTACCTCCCAAAATAGTAGGAAAAATCTAAGACGCATTTTATCGAACACCTTTGCCGCAGTAATAGTAATTCCCAATTACCATGAACACAAAATCACCATGGGCTAATGCTCAAGGAAAGCGGCCTTTCCATGCCGCGATGGGTCGTTTTAGTGCTTCTGTCTTCTTCCACACCGCTCGATTAATTTGATGAATCTATGTGTCTCGACA...

XM_057956573.1
AGGAAAGCGGCCTTTCCATGCCGCGATGGGTCGTTTTAGTGCTTCTGTCTTCTTCCACACCGCTCGATTAATTTGATGAATCTATGTGTCTCGACAACACATAGTACTCTCCGCCTTTCTTGGAGAACAGAGAGAGAGGGAGAGTGGGTGGGGGAGAGATCTGTAATGGCTCAGGCGCTTTTCCAATCACCTTCTATGGATCTCTCCAACAATTCATCTAAAGCATCTGATATATTTGGTTCCCAGCTGAGATCTCTGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131026655
ATGAATCTATGTGTCTCGACAACACATAGTACTCTCCGCCTTTCTTGGAGAACAGAGAGAGAGGGAGAGTGGGTGGGGGAGAGATCTGTAATGGCTCAGGCGCTTTTCCAATCACCTTCTATGGATCTCTCCAACAATTCATCTAAAGCATCTGATATATTTGGTTCCCAGCTGAGATCTCTGGAAATTGAGCAGACCCAGTTGAGGTTTTTGGATTCTTCTAAAAATCCCACTGTGCGATTGAAGGCCTTAATGGAGTC...

LOC131026655
ATGGCTCAGGCGCTTTTCCAATCACCTTCTATGGATCTCTCCAACAATTCATCTAAAGCATCTGATATATTTGGTTCCCAGCTGAGATCTCTGGAAATTGAGCAGACCCAGTTGAGGTTTTTGGATTCTTCTAAAAGAAATCCCACTGTGCGATTGAAGGCCTTAATGGAGTCCCCGGGCCTAGCTCAGGATACCGTGGAGAACAAGCCGAAAGTCATGAGGGTGGGCAAAGAAGTGTCAGATCATTTCAAGGAGTTGAA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057812553.1
MAQALFQSPSMDLSNNSSKASDIFGSQLRSLEIEQTQLRFLDSSKRNPTVRLKALMESPGLAQDTVENKPKVMRVGKEVSDHFKELKHRFLSFKKDKYLSNLEHYKGLAEAQAPKFMVIACADSRVCPSSILGFQPGEAFVVRNVANLVPPHGHGPTETNAALEFAVNSLEVENLLVIGHSCCGGIKALMSLQDEVISSSFTKSWVVLGKPARLQTEAAASDLSFDQQCRHCEKESINRSLMNLLTYPWIEERVIRGKLS...

XP_057812554.1
MAQALFQSPSMDLSNNSSKASDIFGSQLRSLEIEQTQLRFLDSSKNPTVRLKALMESPGLAQDTVENKPKVMRVGKEVSDHFKELKHRFLSFKKDKYLSNLEHYKGLAEAQAPKFMVIACADSRVCPSSILGFQPGEAFVVRNVANLVPPHGHGPTETNAALEFAVNSLEVENLLVIGHSCCGGIKALMSLQDEVISSSFTKSWVVLGKPARLQTEAAASDLSFDQQCRHCEKESINRSLMNLLTYPWIEERVIRGKLSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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