当前解析结果
SmilChr05G000152| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000152 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000152 |
| 描述 | probable disease resistance RPP8-like protein 2 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 1228255 - 1229622 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024738 |
|---|---|
| GeneID | 131024738 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024738 |
| 原始查询 | SmilChr05G000152 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable disease resistance RPP8-like protein 2 |
| 产物 | probable disease resistance RPP8-like protein 2 |
| Arabidopsis | AT1G53350 (AT1G53350)Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.3; qcov=0.844; evalue=1.69e-10; confidence=low |
| Rice | Os07g0186500- identity=24.2; qcov=0.754; evalue=5.05e-06; confidence=weak |
| GO | GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF23598 (LRR_14) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024738 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057810260.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057810260.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057810260.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057810260.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057810260.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057810260.1PF23598
LRR_14 125-405 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057810260.1 |
Pfam | PF23598 |
LRR_14 | Repeat | 125 | 405 | 4.3e-14 | 52.8 | Leucine-rich repeat region |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。