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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000154`

染色体: Chr05 坐标: 1247792-1249561 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000154`
名称	SmilChr05G000154
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP12-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1247792 - 1249561 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984929`
GeneID	`130984929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984929`
原始查询	`SmilChr05G000154`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP12-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP12-like
Arabidopsis	`AT5G64350` (FKBP12) FK506-binding protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836556] identity=74.1; qcov=0.933; evalue=1.56e-61; confidence=high
Rice	`Os02g0760300` (OsFKBP12) - identity=71.4; qcov=0.933; evalue=2.24e-59; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057763624.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057763624.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057763624.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057763624.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1247950`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B78,C8,D7
`Chr5:1247950`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B78,C8,D7
`Chr5:1247962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:1247987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C22,C8
`Chr5:1248017`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr5:1248017`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr5:1248165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1248201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:1249114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:1249117`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B99,C87
`Chr5:1249117`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr5:1249343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763624.1

120 aa

120

FKBP_C

PF00254 FKBP_C 23-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763624.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	23	117	4.2e-27	95.0	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907641.1
ATAGATTTATTGAATAAAAAAAATATCTCCTACCAACTACCAATGAACACGTGCACTATCCGTTGCGCTTCACTCACTTCAAAGCTGAAAGTTGAAACACTGAAGAAGATTAAGACGAGAGAGAAAAATATTGTGATCAGAGTTGGATGCAATGCTTGCTTGCCCAATCAGAGCAATGGGAGTGGAGAAGGAGTTGCTGAAACCGGGAAGCGGCCCGAAGCCCCTTCCCGGTCAAAACGTCACCGTTCACTGCACCGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984929
ATGCTTGCTTGCCCAATCAGAGCAATGGGAGTGGAGAAGGAGTTGCTGAAACCGGGAAGCGGCCCGAAGCCCCTTCCCGGTCAAAACGTCACCGTTCACTGCACCGGATTCGGCAAAAATCGAGATCTCACCAAAAAATTCTGGAGCACCAAGGATCCTGGGCAGAAGCCTTTCACTTTCCAAATCGGTCGAGGCCAAGTTATTAAGGGTTGGGATGAAGGCGTCTTGGGAATGCAAGTGGGAGAAGTTGCTCGATTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763624.1
MLACPIRAMGVEKELLKPGSGPKPLPGQNVTVHCTGFGKNRDLTKKFWSTKDPGQKPFTFQIGRGQVIKGWDEGVLGMQVGEVARLKCSPDYAYGSSGFISWGIQPNSDLVFDVELLSVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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