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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000177`

染色体: Chr05 坐标: 1393411-1398093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000177`
名称	SmilChr05G000177
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1393411 - 1398093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026636`
GeneID	`131026636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026636`
原始查询	`SmilChr05G000177`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
产物	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
Arabidopsis	`AT4G10490` (AT4G10490) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826641] identity=34.6; qcov=0.864; evalue=4.83e-57; confidence=low
Rice	`Os08g0480200` (2ODD19) - identity=38.6; qcov=0.775; evalue=5.61e-75; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812535.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812535.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057812535.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812535.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1393420`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A19,A7,A9,B108,B11,B110,B113,B12,B123,B13,B130,B133,B134,B136,B17,B19,B2,B22,B26,B44,B47,B55,B57,B64,B77,B79,B85,B86,B88,C14,C23,C25,C28,C3,C31,C35,C41,C44,C45,C56,C61,C65,C7,C76,C77,C83
`Chr5:1393437`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A19,A7,A9,B108,B11,B110,B113,B12,B123,B13,B130,B133,B134,B136,B17,B19,B2,B22,B26,B44,B47,B55,B57,B64,B77,B79,B85,B86,B88,C14,C23,C25,C28,C3,C31,C35,C40,C41,C44,C45,C56,C61,C65,C7,C76,C77,C83,D2
`Chr5:1393489`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A19,A21,A4,A5,B1,B100,B102,B103,B115,B119,B121,B122,B123,B127,B130,B133,B17,B21,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B35,B45,B46,B47,B5,B50,B59,B60,B62,B63,B65,B7,B81,B84,B91,B93,B97,C12,C20,C25,C30,C32,C41,C46,C47,C49,C50,C54,C57,C58,C64,C66,C68,C7,C73,C81,C85,C9,D4,D8
`Chr5:1393499`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A3,B102,B103,B104,B53,B56,B64,B69,B74,C1,C15,C2,C53,C62,C66,C74
`Chr5:1393574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:1393609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr5:1393613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C70
`Chr5:1393648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B33,B41,D11
`Chr5:1393675`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,A8,B105,B110,B113,C22,C37,C79
`Chr5:1393692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C14,C28,C45,C61
`Chr5:1393699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B129,B53
`Chr5:1393727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B112,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812535.1

391 aa

196

391

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 85-188 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 240-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812535.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	85	188	4.7e-24	86.0	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057812535.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	240	333	4.7e-29	101.4	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956552.1
TCATGGTAAGTATTGCTTCAATTGGAAGCTCACCATCTCTATATATTCTGCAGTTCTGCACCCCAAACTCAAGCAAAGAGGAGAAAAAAAAGGAAATTAAGCTGAAAATGGCATCAGTTGATGAAGCTTCTGATTCATTTACACCGTTTGAATTCGACACCACCTCAAAAGTTGCAGCAGATTCATCTCCTTTGAAATCGGTCCCTTCAAAATTCATCTTCAGCAATGATCGCACTGCTCTCACTTGCGACTCACTCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026636
ATGGTAAGTATTGCTTCAATTGGAAGCTCACCATCTCTATATATTCTGCAGTTCTGCACCCCAAACTCAAGCAAAGAGGAGAAAAAAAAGGAAATTAAGCTGAAAATGGCATCAGTTGATGAAGCTTCTGATTCATTTACACCGTTTGAATTCGACACCACCTCAAAAGTTGCAGCAGATTCATCTCCTTTGAAATCGGTCCCTTCAAAATTCATCTTCAGCAATGATCGCACTGCTCTCACTTGCGACTCACTCCCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812535.1
MVSIASIGSSPSLYILQFCTPNSSKEEKKKEIKLKMASVDEASDSFTPFEFDTTSKVAADSSPLKSVPSKFIFSNDRTALTCDSLPTVDFSALVGGDPHQRSKAVHDLATACREWGFFILVNHGVADSLMDALFRAVKEFFSLSDSEKKQYEAKSVSDPIKYCGNFNVTTSNRSFTLWRENLKFYVHPNFYCPHRPQLLRDVVLEYIRKVATKLIEDVCEALELNQHYVDEILKMDSSLQLFAANYYPRCPQPDQAIGLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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