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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000179`

染色体: Chr05 坐标: 1413347-1417718 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000179`
名称	SmilChr05G000179
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1413347 - 1417718 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026643`
GeneID	`131026643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026643`
原始查询	`SmilChr05G000179`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
产物	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
Arabidopsis	`AT4G10490` (AT4G10490) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826641] identity=38.2; qcov=0.917; evalue=5.23e-63; confidence=medium
Rice	`Os08g0480200` (2ODD19) - identity=43.1; qcov=0.826; evalue=6.18e-84; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812543.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812543.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812543.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812543.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812543.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1413421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B54,C55,D9
`Chr5:1413422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:1413580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B115
`Chr5:1415117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B26,C21
`Chr5:1415169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B76,B81,C16
`Chr5:1415239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C65
`Chr5:1415239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr5:1415265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:1417060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B14,C17,C84
`Chr5:1417079`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr5:1417079`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr5:1417095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B86,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812543.1

362 aa

181

362

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 50-155 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 208-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812543.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	50	155	3e-23	83.4	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057812543.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	208	301	7.9e-28	97.5	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956560.1
AGCAGTTCTGCACCCCAAACTCAAGAAAAGAAAAGAAAACGGAAATTAAGCTGAAAATGGCATCAGTTGTTGAAGCTTCTGATTCGTTTACACCGTTTGAATTCGACACCACCTTAAAAGTTGCAGCAGATTCTTCTTCTGTGAAATCGGTCCCTTCAAAATTCAACTTCAGCAATGATCGCTCTGCTCTCACTTGTGTCTCACTCCCCACCGTCGATTTCGCAGCCCTCGTCGGCGGCGATCCTCATCAACGCTCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026643
ATGGCATCAGTTGTTGAAGCTTCTGATTCGTTTACACCGTTTGAATTCGACACCACCTTAAAAGTTGCAGCAGATTCTTCTTCTGTGAAATCGGTCCCTTCAAAATTCAACTTCAGCAATGATCGCTCTGCTCTCACTTGTGTCTCACTCCCCACCGTCGATTTCGCAGCCCTCGTCGGCGGCGATCCTCATCAACGCTCCAAAGCTGTCCACGGCCTCGCCACAGCATGTCGAGAATGGGGTTTCTTCATCCTTGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812543.1
MASVVEASDSFTPFEFDTTLKVAADSSSVKSVPSKFNFSNDRSALTCVSLPTVDFAALVGGDPHQRSKAVHGLATACREWGFFILVNHGVAESLMEAMFRAVKEFFILPESEKKQYEAKSASDPIKCGNFNVVDTSNRSFTLWRDYLKLYVHPNFHCPHQPQLLRDVVLEYTQIIRKLARKLIEAVCEALELNQRYVDETLNMDSSFQFIATNYYPRCPQPDEAIGIPPHTDVGLFTLLIHNGVAGLQIEHDGKWFNVDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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