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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000180`

染色体: Chr05 坐标: 1430042-1432537 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000180`
名称	SmilChr05G000180
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1430042 - 1432537 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026651`
GeneID	`131026651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026651`
原始查询	`SmilChr05G000180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
产物	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase 19-like
Arabidopsis	`AT2G36690` (AT2G36690) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818241] identity=41.7; qcov=0.813; evalue=1.69e-75; confidence=medium
Rice	`Os08g0480200` (2ODD19) - identity=45.1; qcov=0.895; evalue=2.16e-90; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812549.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057812549.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812549.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812549.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1430183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr5:1430189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1430191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:1430218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:1430254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B31,C82
`Chr5:1430259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C84,D6
`Chr5:1430332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:1430339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:1430347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:1430372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr5:1431191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:1431198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812549.1

342 aa

171

342

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 47-145 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 199-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812549.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	47	145	2.1e-26	93.6	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057812549.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	199	292	1.6e-29	102.9	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956566.1
GGCACCCGATGTTTTATTTGTCCACATGCATTCAACTTGAATGAAAAACTTGCAAATGGCAAATGGCAAATGGCAAATTGGCAACTACTACTACTCACTAGTCACTATACATAGAGATGAGAATAGCCCTCACACCATTGATATCTAAAACACACACACACACACACCAAAAATGGCACCACCAATAGCTCTGCCGCTGCCTCGGCCGCCGCCAGCCATCACAAGCGTGAGAAAGCTAGCAAACCTGAGCTCCATCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026651
ATGGCACCACCAATAGCTCTGCCGCTGCCTCGGCCGCCGCCAGCCATCACAAGCGTGAGAAAGCTAGCAAACCTGAGCTCCATCCCTTCCAACTACGCCCACAACGCCGAAACCGAGGCTTCGGAGCCCGGGGATTCGATCCCCGTCGTCGATCTCTCGCTTCTCGCCTCCGGCCACGCCGGGGCCGTCGAGGATCTGGACAAGGCGTGCCGGGAGTGGGGCTTCTTCATGATAGTGAACCACGGGATACCGGGGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812549.1
MAPPIALPLPRPPPAITSVRKLANLSSIPSNYAHNAETEASEPGDSIPVVDLSLLASGHAGAVEDLDKACREWGFFMIVNHGIPGELVKGVLDATREFFELPEEEKPEFQPKDVLTPVRYGTSFNTEKEEVFCWRDFLKVFVHPEFNCPERPESLRKLVIEYSERCREVTRRLLIGVSKSLGLEEGEAEAALGMASTLQIFIANLYPRCPEPEAAMGMPPHSDHGLFTLLIENGVGGLQIQRGGRWINVKAQPNSILVNT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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