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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000187`

染色体: Chr05 坐标: 1499834-1573041 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000187`
名称	SmilChr05G000187
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1499834 - 1573041 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026599`
GeneID	`131026599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026599`
原始查询	`SmilChr05G000187`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=24; qcov=1.02; evalue=3.41e-35; confidence=weak
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=25.4; qcov=0.837; evalue=2.57e-37; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057812492.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812492.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812492.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812492.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812492.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1570197`	`ATT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B91
`Chr5:1570201`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A1,B115,B16,B73,B83,C24,C28,C34,C39,C59,C72,C81,D3
`Chr5:1570213`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C30
`Chr5:1570213`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C30
`Chr5:1570221`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C30
`Chr5:1570221`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C30
`Chr5:1570246`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A8
`Chr5:1570246`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A8
`Chr5:1570251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B78,C84
`Chr5:1570309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B56,B96
`Chr5:1570309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:1570330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B88,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812492.1

863 aa

432

863

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 175-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812492.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	325	5.8e-28	98.3	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102350.1
ACAGCTTTTCAAATCATTTACTGAAGTTCTTGAATGTGGTATTGAATGTTTCTGAATTTGTATCAAAACCAGCTGCTGCCATCGTTGACTTGCGCCAACTCCTCCAAGAGGCGACTGAATTGCAGTTGACTTTAAGCTTCATTTGGGTATGGCGGCTTTTGGTGCGGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCTGCGTATTCTTCAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTGCAACCTGTCTACG...

XR_009102349.1
ACAGCTTTTCAAATCATTTACTGAAGTTCTTGAATGTGGTATTGAATGTTTCTGAATTTGTATCAAAACCAGCTGCTGCCATCGTTGACTTGCGCCAACTCCTCCAAGAGGCGACTGAATTGCAGTTGACTTTAAGCTTCATTTGGGTATGGCGGCTTTTGGTGCGGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCTGCGTATTCTTCAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTGCAACCTGTCTACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026599
ATGGCGGCTTTTGGTGCGGCGGCTTCTCTCAAGAATACGATTCTGCGTATTCTTCAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTGCAACCTGTCTACGACGAGATGGATCGATTGCAGAAAGTTCTGCTAAAATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGGAGGTGAATGCTGCGGATGAACTCATCAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTACTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812492.1
MAAFGAAASLKNTILRILQSSRISLVSHSPQILQPVYDEMDRLQKVLLKLDETSCSKIRTEVNAADELIKEAVWEFEDLLESHILPQILPQLESERNNLSFSVDLQSLQHHVDCFVEMVKMMELEYTKEMKNMAEEEGEPISSRIDFGGIKSKMVGKSYAFQEARDNLLEGKDYSIIGMAGVGKTTLAKRIFEDPSIRSHFEFRAWVKVGRKCKPNELLRCVLAQVDPNAYRMLAQGDDDDEELVGLLKEKLQDKKCLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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