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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000195`

染色体: Chr05 坐标: 1554790-1556175 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000195`
名称	SmilChr05G000195
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1554790 - 1556175 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024751`
GeneID	`131024751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024751`
原始查询	`SmilChr05G000195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=25.4; qcov=0.811; evalue=1.2e-06; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=24.5; qcov=0.991; evalue=4.8e-07; confidence=weak
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057810272.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057810272.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810272.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810272.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1554791`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A11,A9,B104,B106,B11,B13,B140,B18,B26,B31,B33,B35,B45,B51,B60,B63,B66,B69,B7,B70,B80,B93,C32,C40,C5,C56,C68,C72,C80,C84,D1,D8,D9
`Chr5:1554797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B92,D2
`Chr5:1554805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B17,B28,B71
`Chr5:1554806`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B60,B69,C80,C84
`Chr5:1554806`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B60,B69,C80,C84
`Chr5:1554815`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C72,C77
`Chr5:1554815`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C72,C77
`Chr5:1554818`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B131,B89,B94,C52
`Chr5:1554818`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B131,B89,B94,C52
`Chr5:1554858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B63,D1,D9
`Chr5:1554863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C62,D9
`Chr5:1554892`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B133,B35,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810272.1

461 aa

230

461

LRR_14

PF23598 LRR_14 126-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810272.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	126	411	3.9e-16	59.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954289.1
ATGTTCTTCCTCTATATGGGAGCTTTCCCTCCTTATGCTGATCAGATTCCATTCCATATTAATAATCTTTTGGGTATTGAGGGATTTCTTGAACCGAACGATGAAAAAAGTTTTGAAGGTTTCTGGGAAAAGCTTTCTCATGGGTATTATCTTGTTCTCGACACAGAAAATTCTTGGTATTTGGGTAGACGGTATCGCGTGCATTCTTGTTGGCAGCACTTATGTAAGGTAGAAGCTAGTAGGATCAAGTTTCTACATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024751
ATGTTCTTCCTCTATATGGGAGCTTTCCCTCCTTATGCTGATCAGATTCCATTCCATATTAATAATCTTTTGGGTATTGAGGGATTTCTTGAACCGAACGATGAAAAAAGTTTTGAAGGTTTCTGGGAAAAGCTTTCTCATGGGTATTATCTTGTTCTCGACACAGAAAATTCTTGGTATTTGGGTAGACGGTATCGCGTGCATTCTTGTTGGCAGCACTTATGTAAGGTAGAAGCTAGTAGGATCAAGTTTCTACATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810272.1
MFFLYMGAFPPYADQIPFHINNLLGIEGFLEPNDEKSFEGFWEKLSHGYYLVLDTENSWYLGRRYRVHSCWQHLCKVEASRIKFLHVLRGCDDVIKDQRRLCAHYNSLFGFKQVYDSIKSDCASTVRSLLCVGPYHPYPIPIVAMGFKLLRVLYALGVRFYHIPIEILKLVCLRYLSLKCNGELPPSISNLFHLQFLIIHPHMYIKKLGVQSYMPVQIWDMQELEHLEIIGRDLPTPNTDDATLNKLISLLGVSANSCTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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