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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000199`

染色体: Chr05 坐标: 1595734-1598962 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000199`
名称	SmilChr05G000199
描述	SUN domain-containing protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1595734 - 1598962 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026632`
GeneID	`131026632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026632`
原始查询	`SmilChr05G000199`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SUN domain-containing protein 1
产物	SUN domain-containing protein 1
Arabidopsis	`AT5G04990` (SUN1) SAD1/UNC-84 domain protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830381] identity=43.6; qcov=1.06; evalue=6.19e-118; confidence=medium
Rice	`Os05g0270200` (OsSAD1) - identity=47.8; qcov=0.833; evalue=7.49e-110; confidence=high
GO	GO:0005635 (nuclear envelope); GO:0006998 (nuclear envelope organization); GO:0043495 (protein-membrane adaptor activity)
KEGG	smil04820 (Cytoskeleton in muscle cells - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07738 (Sad1_UNC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057812531.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057812531.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057812531.1`
4	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057812531.1`
5	Nucleus inner membrane	Nucleus inner membrane	0.60000	`XP_057812531.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1596030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B131
`Chr5:1596203`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B139,C34
`Chr5:1596203`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B139,C34
`Chr5:1596221`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr5:1596221`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C34
`Chr5:1596225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr5:1596226`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr5:1596226`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C34
`Chr5:1596277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	43	A11,A16,B105,B12,B123,B126,B129,B132,B135,B140,B15,B16,B18,B19,B38,B39,B48,B49,B53,B67,B69,B73,B74,B78,B80,B95,C11,C27,C33,C35,C4,C41,C43,C49,C50,C57,C60,C62,C72,C77,C78,C80,D3
`Chr5:1596291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A11,A22,B102,B105,B109,B12,B123,B126,B129,B131,B132,B135,B15,B16,B18,B19,B38,B39,B43,B44,B48,B49,B53,B6,B67,B69,B73,B74,B78,B80,B87,B90,B94,C11,C26,C27,C33,C35,C36,C4,C41,C43,C49,C50,C55,C57,C6,C60,C62,C74,C77,C78,C80,C9,D3
`Chr5:1596320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C4,C74
`Chr5:1596323`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B131,C55,C62,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812531.1

437 aa

218

437

Sad1_UNC

PF07738 Sad1_UNC 295-425 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812531.1`	Pfam	`PF07738`	Sad1_UNC	Family	295	425	5.5e-38	130.7	Sad1 / UNC-like C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956548.1
AATAATTCAAATTTTATAACCGCTCCCTCAGTTTACTTGAAATTTAAGCGAAGTCTCCTCCTTCCCTCTCTCTCTCTCACACACAGACACACGCATAGGAAGTTTTCAATTTCCATTTTCCCTCTTCTTTCTCTCTAGGGTTTGCTCAACGCACTGCTCCAATTTCATCGATCAATTCTCCGAAATTGGACTCGCAAGTCCGATTCACTTCTTCTCGGATTCGAGATCGCACAAATGTCCGCCTCCACCGTTTCAGTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026632
ATGTCCGCCTCCACCGTTTCAGTCACCGCTAATCAGGGGCCCACCACTCGCCGCCGGGCGGTCGAGAAAAATCTTCCGAGCGGTGGCTCCGATTTAGCGGCTGCGACCGCAGTAATCACGGAGTCCGACGCTCGGCTCACCGCCGGGGACACTGCCGCAGCGATTTTGAGGGATGCGAGGAGAACTCCTTCCCAGTTCCAGGCGAAGAAGGCCGGCGTGGGCAAAAAGCCGGCGAAGCCGCGCTGGCTGACTCTGATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812531.1
MSASTVSVTANQGPTTRRRAVEKNLPSGGSDLAAATAVITESDARLTAGDTAAAILRDARRTPSQFQAKKAGVGKKPAKPRWLTLISILTKNLALVVVLLGLVQMVRWTVVNSGRDIGDLSIMSGDFEGKLAEVEKSVTKTMKAMQVQMSALEHQVEDGIGSVRKEFDEKIERKGAEVDLKLKALDVRSDAFEKFMDGFRTKSLLSKEEFSEFFEEFKKTRKGDITEVSVDDIRNYAKEVVMKEIEKHAADGLGMVDYAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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