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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000204`

染色体: Chr05 坐标: 1615800-1622626 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000204`
名称	SmilChr05G000204
描述	ethylene-responsive transcription factor WRI1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1615800 - 1622626 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026638`
GeneID	`131026638`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026638`
原始查询	`SmilChr05G000204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor WRI1-like
产物	ethylene-responsive transcription factor WRI1-like
Arabidopsis	`AT3G54320` (WRI1) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824599] identity=78.8; qcov=0.527; evalue=2.85e-104; confidence=medium
Rice	`Os09g0423800` (AP2/EREBP#153) - identity=72.6; qcov=0.494; evalue=5.77e-93; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026638

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057812538.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812538.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812538.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057812538.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057812538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1616076`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr5:1616076`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr5:1616080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:1616092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C2
`Chr5:1616128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr5:1616167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C26
`Chr5:1616232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B17,C47
`Chr5:1616239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1616257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:1616287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:1616458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:1616540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B118,B31,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812538.1

385 aa

192

385

AP2

PF00847 AP2 60-117 aa PF00847 AP2 160-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812538.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	60	117	2e-23	83.1	AP2 domain
`XP_057812538.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	160	211	2e-23	83.1	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956555.1
AGAATTTTCCTCCTCCCTCACAAACTCCCTTGTCTTCTTCTTCCTTTTTCCTTTTCCCTTTTCTTTTTTTGCTTCAAAATTCTCAGCCGTGACTCCATTCCAAGCTTGTATTTTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTACGCAGAGTTAATTTTGGCAAACCACTTTAGCTCACCAAAAAAGAAGCCTTTTTCCTCTCCTCTTAATTCCCCTTTTGTTGTTGATTCCACACCAACCCACCCATCTTCACACACATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026638
ATGAAGCGCAAGTCTCCTTCATCTTCGTGCTCCTCCTCTTCATCTTCCTGCTGCATCGAATCGCCGTCAATCGCCCAACCCAGCGCGCCGGAATCCAAGCCCAAGCCCAAGCGCGTCCGAGCCAAGAGGAATCAGAGCGACAATTCCGCCACCTCCGCTAAATCACGCAGCTCCATTTACAGAGGCGTCACCAGGCATCGGTGGACTGGCAGGTACGAAGCTCACCTCTGGGATAAGACCACATGGAACAGCATCCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812538.1
MKRKSPSSSCSSSSSSCCIESPSIAQPSAPESKPKPKRVRAKRNQSDNSATSAKSRSSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDKTTWNSIQNKRGRQIYLGAYDNEEDAARTYDLAALKYWGPATILNFPVEGYTKDVEEMQKLSKEEYLASLRRRSSGFSRGVSKYRGVARHHHNGRWEARIGRVCGNKYLYLGTYSTQEEAAAAYDMAAIEFRGPNAVTNFDISNYADKLKKFIPEVQVEEVHVKQETHSTPPDEVQADEDPH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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