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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000210`

染色体: Chr05 坐标: 1663361-1665190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000210`
名称	SmilChr05G000210
描述	30S ribosomal protein S20, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1663361 - 1665190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984926`
GeneID	`130984926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984926`
原始查询	`SmilChr05G000210`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S20, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein S20%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G15190` (PRPS20) chloroplast 30S ribosomal protein S20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820750] identity=75.9; qcov=0.648; evalue=7.71e-55; confidence=high
Rice	`Os01g0678600` (ASL1) Albino Seedling Lethal1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4325273] identity=54.8; qcov=0.693; evalue=3.91e-37; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015935 (small ribosomal subunit); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01649 (Ribosomal_S20p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057763622.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763622.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763622.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763622.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1663506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B55,C52
`Chr5:1663512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C82
`Chr5:1663563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B22
`Chr5:1663662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B74,C82
`Chr5:1664684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B87,B92
`Chr5:1664758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C8
`Chr5:1665028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763622.1

179 aa

179

Ribosomal_S20p

PF01649 Ribosomal_S20p 72-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763622.1`	Pfam	`PF01649`	Ribosomal_S20p	Family	72	158	1.7e-19	70.9	Ribosomal protein S20

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907639.1
GCTTAAACACGCTTCTGAAAATGCTAGTACCTCCGCAACGCTTTTTCGCCATATATTCACAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATCAAGTGTTAGCCTTGGATAAGGTTTCCTCAACCAAAGCATCATCTTCACACGCACAATCGAGAAAATGGCTGCAGCAATGGCGCATTGTTACGGACTCACGGCCAAGCTGAATACGCTTTCTCTCTCTAGCGCGCCCAATGCCGCATTCAAGCCGCTCAGCTTTTCGTCCAACACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984926
ATGGCTGCAGCAATGGCGCATTGTTACGGACTCACGGCCAAGCTGAATACGCTTTCTCTCTCTAGCGCGCCCAATGCCGCATTCAAGCCGCTCAGCTTTTCGTCCAACACTTCCACCGTCAGTCTTTTCTCAAGAGGTCTGGTGTCGGTCTGCCCGGTGCAATTGAGCTCTAACCGGCGCTCGATTGTGTGCGAAGTGGGGACGAAGAAGGCGGATTCAGCGGCAAAGAGGGCTCGCCAAGCGGAGAAGAGGCGGATTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763622.1
MAAAMAHCYGLTAKLNTLSLSSAPNAAFKPLSFSSNTSTVSLFSRGLVSVCPVQLSSNRRSIVCEVGTKKADSAAKRARQAEKRRIYHKAKKSEVRTRMKKVLEALEVLVKKQGVESEEILPVEKMIAEAYSAIDKAVKAGTLHRNTGARRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPSPSVATTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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