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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000211`

染色体: Chr05 坐标: 1666229-1673114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000211`
名称	SmilChr05G000211
描述	uncharacterized SmilChr05G000211
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1666229 - 1673114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984915`
GeneID	`130984915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984915`
原始查询	`SmilChr05G000211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim44-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008229]; symbol=AT5G27395; hit=AT5G27395; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim44-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008229]; symbol=AT5G27395; hit=AT5G27395; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G27395` (AT5G27395) Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim44-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008229] identity=55.1; qcov=0.918; evalue=1.91e-97; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04280 (Tim44)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057763598.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057763598.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057763598.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057763598.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1666453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B16,B59,B79,D3
`Chr5:1666460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:1666505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr5:1669182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:1672203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1672230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:1672550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:1672554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B140,B38,B39,C13
`Chr5:1672782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B58,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763598.1

269 aa

134

269

Tim44

PF04280 Tim44 128-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763598.1`	Pfam	`PF04280`	Tim44	Domain	128	265	3.2e-23	83.2	Tim44-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907615.1
TAGTTTATAGTAAAACCCCAATTCTAATAGTGAAGCTAAACCCTCCCTAAATCTCCAAAACCCTAGCAAAACATCCACTTTCTCAATGGCGAGATCTCTGACGCAGTCATGGCGCCGAATTCTGACATATCAGACGCCGTCGCGGTGGTGCTTTGAACAATCATCGGAGCCTTCTCATTTTCTGCTGAAATCACTACCAGAGGTCAAGTCCCCAGGCATCAGCGGTGTCAGGTTCATTAGTGCACAAGCAACAGCAAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984915
ATGGCGAGATCTCTGACGCAGTCATGGCGCCGAATTCTGACATATCAGACGCCGTCGCGGTGGTGCTTTGAACAATCATCGGAGCCTTCTCATTTTCTGCTGAAATCACTACCAGAGGTCAAGTCCCCAGGCATCAGCGGTGTCAGGTTCATTAGTGCACAAGCAACAGCAAGTAATCCTGCTCAAACTCGACAATCGGGGGCTGTTAAATTAGCACTTACTAGCGTTGGAACTGTGTTCGACCCATATTCACCAAGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763598.1
MARSLTQSWRRILTYQTPSRWCFEQSSEPSHFLLKSLPEVKSPGISGVRFISAQATASNPAQTRQSGAVKLALTSVGTVFDPYSPSEPIPFWRRWFTRPGLKRTKEEFLSQLKSLYAISQVKKKCGHSKQKFYGEAVHLYQQINTLVANGDKKSLRKCVTENMYSVFKNEIKHRETVWDHIHWELIMPIVKIRTLRARLIGLDKNDIGKSFAQITIEFLSKQKFEAYDSNGAVVAGDKNKEVLVRDIWVFERSLFHHGSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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