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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000212`

染色体: Chr05 坐标: 1672779-1674811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000212`
名称	SmilChr05G000212
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1672779 - 1674811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026635`
GeneID	`131026635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026635`
原始查询	`SmilChr05G000212`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
产物	inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 2-like
Arabidopsis	`AT5G04890` (RTM2) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830370] identity=44.4; qcov=0.275; evalue=6.86e-21; confidence=weak
Rice	`Os10g0437700` - identity=37; qcov=0.234; evalue=3.01e-12; confidence=weak
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057812534.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812534.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057812534.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057812534.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1673415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:1673458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B100,B124,B22,C55
`Chr5:1673557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C86
`Chr5:1673596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr5:1673647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B22
`Chr5:1673661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B14,B4
`Chr5:1673694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B139,B68,C57,D4
`Chr5:1673707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B74,C82
`Chr5:1673716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C74
`Chr5:1673733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C48,C75
`Chr5:1673741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B55
`Chr5:1673754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B33,C8,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812534.1

393 aa

196

393

HSP20

PF00011 HSP20 26-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812534.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	26	109	1.9e-10	41.5	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956551.1
ATCTCAATTTCGATAACTTCGTCATAGCAAAACTCAATATACATGCCTTCTTACTCAGATTTCCCAAGTTTTTGTTCATATATAATGGAATTTAAGATCATAGGCCAATAATCACAACACACAAAACATACATACATTTCACCATCAAATAATTAAGGATGGCGATGAGGGGGAGAGGCGGAGCAAGGGGCGGCGTTTCGCCATCGTACGAAGATTTCAAGCCCAACTCGGAATGGCAACACGATGATCATTCCCATAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026635
ATGGCGATGAGGGGGAGAGGCGGAGCAAGGGGCGGCGTTTCGCCATCGTACGAAGATTTCAAGCCCAACTCGGAATGGCAACACGATGATCATTCCCATAGCCTCATTATTTCCATTCCTGGTTTCTTGAAGGAGCAACTTAGGGTTTCGACAGAATCTCGTAACATTATTAGGGTTCGTGGCGAGCGGCTCATGGCAGACAACAAATGGAGCCGTTTCCTCGAGGATTTTGAGGTTCCTGAAAACTCCGACATGAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812534.1
MAMRGRGGARGGVSPSYEDFKPNSEWQHDDHSHSLIISIPGFLKEQLRVSTESRNIIRVRGERLMADNKWSRFLEDFEVPENSDMNSVRARFIEGALTITVPKKTIDKPHEPTPPKKGVETHQDEKQEHSSTRTKQAKGDKAKAKFEKVVAKEEKDEKVKLKTDDVVASKDKGKEGKRKEVIESSGVEQEAFTKAMKGLAPKGKEGEGKEKEVIKSSGGEHEAFTKAMKGLAAKDTGKEGKEKEAIESSGAKHEAFTKAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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