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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000216`

染色体: Chr05 坐标: 1695699-1698701 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000216`
名称	SmilChr05G000216
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1695699 - 1698701 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026606`
GeneID	`131026606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026606`
原始查询	`SmilChr05G000216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.6; qcov=1.01; evalue=1.91e-65; confidence=low
Rice	`Os09g0479500` - identity=29.3; qcov=0.824; evalue=4.14e-62; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057812499.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057812499.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057812499.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812499.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1696078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B7,B76,C25,C73
`Chr5:1696105`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A4,B106,B108,B110,B129,B139,B20,B34,B42,B43,B61,B66,B67,B74,B77,B8,B83,B93,C29,C46,C63,D3,D8
`Chr5:1696120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D11
`Chr5:1696139`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A1,A11,A13,A19,A2,A3,B106,B11,B114,B13,B134,B25,B27,B30,B47,B53,B56,B58,B60,B66,B68,B69,B7,B70,B76,B77,B81,B85,B94,B96,C1,C12,C15,C16,C18,C2,C22,C26,C3,C30,C35,C36,C37,C39,C43,C45,C56,C60,C64,C66,C73,C74,C76,C77,C84,D10,D2
`Chr5:1696143`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A1,A11,A13,A19,A2,A3,B106,B11,B114,B13,B134,B25,B27,B30,B47,B53,B56,B58,B60,B66,B68,B69,B7,B70,B76,B77,B81,B85,B94,B96,C1,C12,C15,C16,C18,C2,C22,C26,C3,C30,C35,C36,C37,C39,C43,C45,C56,C60,C64,C66,C73,C74,C76,C77,C84,D10,D2
`Chr5:1696184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C19
`Chr5:1696192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C82,D11
`Chr5:1696225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr5:1696226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1696227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:1696231`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B73,C19
`Chr5:1696231`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B73,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812499.1

853 aa

426

853

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 166-328 aa PF23559 WHD_DRP 412-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812499.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	166	328	4.2e-39	134.6	NB-ARC domain
`XP_057812499.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	412	481	2.2e-15	57.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956516.1
GAATTCATAATTAATCTCATTTTCATTCACACTCATCTCATCTCATATTCTCTCTGCAGCTCCCAAAACAACCATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCTCCATCATCCCTGCCCTCCTATTTCTCTCCATGCTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTGAATTTCTCAAAGTCTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026606
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTACTTTCTGCTATGAATATCATAAACAACCTTCTCCATCATCCCTGCCCTCCTATTTCTCTCCATGCTAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTGAATTTCTCAAAGTCTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCCGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCTATGAGGAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812499.1
MAAAYATLLSAMNIINNLLHHPCPPISLHAKQVESLTQKINFLLEFLKVYNPHRGYSKEADPLESRIADAAYAAEHAIESHIFYEEYTIVSHIFDEVKNDGLYEALEKVIKDMASIEEEANQIQGRLGVLHQHQLHTRSTPSDSSRSSSIPQQSSMVGAADVKIQMMDKLTSHCRDLQIIPIVGMGSLGKTTLARTIYEDRLIKFHFDICGWATISQEYVIREIFAGLLHQLNTKFDDNLSEDELGEKLYKHLYGRRYII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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