当前解析结果
SmilChr05G000220| 统一新 Gene ID | SmilChr05G000220 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G000220 |
| 描述 | tyrosine N-monooxygenase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 1717961 - 1720318 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131026624 |
|---|---|
| GeneID | 131026624 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131026624 |
| 原始查询 | SmilChr05G000220 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | tyrosine N-monooxygenase-like |
| 产物 | tyrosine N-monooxygenase-like |
| Arabidopsis | AT5G05260 (CYP79A2)phenylalanine N-monooxygenase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830408] identity=53.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os04g0171800- identity=54.4; qcov=0.941; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131026624 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057812522.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057812522.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057812522.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057812522.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057812522.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:1718692 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr5:1719185 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B48,C22,C34 |
Chr5:1719232 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B1 |
Chr5:1719237 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr5:1719312 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr5:1719320 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,A8,C33 |
Chr5:1719592 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B53,C55,C86 |
Chr5:1719697 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,B85,B95 |
Chr5:1719718 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,C42 |
Chr5:1719749 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B58,C48,C5,C64 |
Chr5:1719772 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr5:1719780 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,B85 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057812522.1PF00067
p450 41-489 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057812522.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 41 | 489 | 3.1e-83 | 280.8 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。