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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000225`

染色体: Chr05 坐标: 1758643-1761786 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000225`
名称	SmilChr05G000225
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1758643 - 1761786 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984948`
GeneID	`130984948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984948`
原始查询	`SmilChr05G000225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=25.6; qcov=1.07; evalue=1.37e-65; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=31.5; qcov=0.639; evalue=2.34e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057763628.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763628.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057763628.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763628.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1759392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B38,B85,C75
`Chr5:1759398`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A9,B136,B18,B30,C61,C7,C80
`Chr5:1759436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B124,B29,B55
`Chr5:1759475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B124,B29,B55
`Chr5:1759484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1759494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B74,B76
`Chr5:1759520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C65,C76,D6
`Chr5:1759593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B128
`Chr5:1759593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:1759599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:1759608`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A6,B100,B60,B72,C79
`Chr5:1759608`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A6,B100,B60,B72,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763628.1

814 aa

407

814

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 156-316 aa PF23559 WHD_DRP 399-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763628.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	156	316	1.4e-39	136.2	NB-ARC domain
`XP_057763628.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	399	465	6.3e-17	62.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009088834.1
TCATCTCATATTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTTGTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCACCCTCCTGTTTGTCTCGTCATCAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAAC...

XM_057907645.1
TCATCTCATATTCTCTGCAACTCCCAAAACAACCATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTTGTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCACCCTCCTGTTTGTCTCGTCATCAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984948
ATGGCAGCAGCTTATGCAACTCTTGTTTCTGCTTTGAATATCATAAACAACCTTCACCATCATCCCCACCCTCCTGTTTGTCTCGTCATCAAACAAGTTGAGTCTCTCACTCAAAAGATTAATTTCCTGCTTGAATTTCTCGAGGGGTATAACCCCCATCGTGGCTACTCCAAAGAAGCGGATCCATTGGAGTCTCGCATTGCAGATGCAGCTTATGCGGCCGAACACGCCATTGAATCTCATATTTTCGATCAGCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763628.1
MAAAYATLVSALNIINNLHHHPHPPVCLVIKQVESLTQKINFLLEFLEGYNPHRGYSKEADPLESRIADAAYAAEHAIESHIFDQLTNNGENMSYDGLYEALEKVIKEMVFIEEEAKQIQGRVGVQHQLPPDSSRSASSIPQQSSMVGADDLKLQLMDKLTSDLLHLQIIPIVGMGGSGKTTLARTVYEERLIKERFDICAWATISQEYIIREIFAVVFRQFNIEVDDDLYEDELGEKLYKHLYGRRYLIIMDDMWSIDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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