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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000230`

染色体: Chr05 坐标: 1786648-1798106 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000230`
名称	SmilChr05G000230
描述	uncharacterized SmilChr05G000230
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1786648 - 1798106 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984951`
GeneID	`130984951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984951`
原始查询	`SmilChr05G000230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fanconi anemia group D2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827156]; symbol=AT4G14970; hit=AT4G14970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	fanconi anemia group D2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827156]; symbol=AT4G14970; hit=AT4G14970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G14970` (AT4G14970) fanconi anemia group D2 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827156] identity=49.1; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0154400` - identity=46; qcov=0.774; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000793 (condensed chromosome); GO:0005634 (nucleus); GO:0007129 (homologous chromosome pairing at meiosis); GO:0031573 (mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0070182 (DNA polymerase binding); GO:1990918 (double-strand break repair involved in meiotic recombination)
KEGG	smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14631 (FancD2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763634.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057763634.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763634.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763634.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1787786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B57
`Chr5:1788504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B24,B38,B39,C10
`Chr5:1788607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B114,B125,B90,B92
`Chr5:1789148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B84,C5
`Chr5:1789269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B82,C28,C32,C60,C68
`Chr5:1789313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C20,D3
`Chr5:1789417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B2,B57
`Chr5:1790651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr5:1790743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B2,B57,C74
`Chr5:1790871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:1790910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:1794014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763634.1

1390 aa

695

1390

FancD2

PF14631 FancD2 58-886 aa PF14631 FancD2 1212-1379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763634.1`	Pfam	`PF14631`	FancD2	Repeat	58	886	3.7e-119	399.9	Fanconi anaemia protein FancD2 nuclease
`XP_057763634.1`	Pfam	`PF14631`	FancD2	Repeat	1212	1379	3.7e-119	399.9	Fanconi anaemia protein FancD2 nuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907651.1
CGCGCCTCTTTTCCACCATCAAAACACACACACACAGTGGAAGAAGCTTCACGCACTACACACACTATGCTTTCCCGCAAACGTCCATCCAAACCCTTCATCCCACCCTTCGCCGCCCCCAAATCCACCAAACTCCTCAAACCCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGAAGATGAACCACAAGCGATGCCGCCCCGTAAAGCCTCTACTGAGGCTCCATTTGACAAGATGGCGTCCGTGCTGGCGGACGCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984951
ATGCTTTCCCGCAAACGTCCATCCAAACCCTTCATCCCACCCTTCGCCGCCCCCAAATCCACCAAACTCCTCAAACCCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGAAGATGAACCACAAGCGATGCCGCCCCGTAAAGCCTCTACTGAGGCTCCATTTGACAAGATGGCGTCCGTGCTGGCGGACGCCGGCTGTACGCTGATCAACCCCGCCGGGCCGCCGTGCCTCCCCTCCGACCTCTACGCCTTCCGCCGACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763634.1
MLSRKRPSKPFIPPFAAPKSTKLLKPSASAAAAAAAEDEPQAMPPRKASTEAPFDKMASVLADAGCTLINPAGPPCLPSDLYAFRRRLDGMFSGDSSLRSQFLEGFCAYVSSSSNLRRVLLPCQRDGFGSTRSESLVRVLLLVKSIQQDLLDMLLEKLPEFFDVDPLVSARGYSLHLDEDVARLILNQLRWLDFLVNSEAFTEKLLQVLTICPHHLKKEIIGSLPEIVGDQNNKILVDSLQQMLQEDSSIIVPVLDSFSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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