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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000237`

染色体: Chr05 坐标: 1826640-1827662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000237`
名称	SmilChr05G000237
描述	PRA1 family protein E-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1826640 - 1827662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984962`
GeneID	`130984962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984962`
原始查询	`SmilChr05G000237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein E-like
产物	PRA1 family protein E-like
Arabidopsis	`AT1G08770` (PRA1.E) prenylated RAB acceptor 1.E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837399] identity=55.8; qcov=0.881; evalue=1.31e-48; confidence=medium
Rice	`Os03g0798400` (OSJNBa0094F01.3) - identity=53.9; qcov=0.808; evalue=2.05e-35; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057763647.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057763647.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057763647.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057763647.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057763647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1826807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B133,D8
`Chr5:1826828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B86,B99,C40,C51
`Chr5:1826840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C51
`Chr5:1826874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr5:1826877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C82
`Chr5:1826881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,C14,C55
`Chr5:1826883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B14,B22,B53,B91
`Chr5:1826885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C4
`Chr5:1826886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C15
`Chr5:1826890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C51
`Chr5:1826891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr5:1826901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763647.1

177 aa

177

PRA1

PF03208 PRA1 25-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763647.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	25	164	4.7e-46	156.6	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907664.1
TACGTGAAATTATATATTAGTGTAATTAATGGCAAAACTAATCATTAATATGAATAAAGTTTTGGGGGATTTTTTTTGCTTTTTAGTTTAGCTTTTATATAAAAAAGCTGAATATCTATTAAAAATTAACCCAAAATCCACGAATTATTTTTGATAGATTCCACATATCAAAGCACACACTCAGATTCCCTCTGTGAATCAGCCCCGACTCCTCCGCCGCATCCGCAGGCTGCCGCCGCCGCCCCCAATCACCACTAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984962
ATGCTCGCAAATTCCGCCTCCCCACGCGGCGGCGCCGCCAAGCCGCAGCTAGTCTCCCGCGCCCGATCCCTCTACGCCGCCCGCCGGCCGTGGCGCCTGCTCTTCGACGTCTCCGCCGTCTCCCTCCCCTTGAGCTACGGCGAGGCCATGTATCGGATCCGCCACAACTTGAACTACTTCCGCGTCAATTACGCCCTAATCACCCTAATTATCCTCTTCTGCGGCCTCGTCTACCACCCCGTCTCCATGATCGTCTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763647.1
MLANSASPRGGAAKPQLVSRARSLYAARRPWRLLFDVSAVSLPLSYGEAMYRIRHNLNYFRVNYALITLIILFCGLVYHPVSMIVFLVVFAAWLWLYFCREDPVVALGRIVDDRVVLVSLGLVTVVALVLTHVGLNVLVALIVALVACGGHAAVRGTEDLFLDESDAAEGGLLSVVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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