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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000242`

染色体: Chr05 坐标: 1849821-1852238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000242`
名称	SmilChr05G000242
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1849821 - 1852238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024758`
GeneID	`131024758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024758`
原始查询	`SmilChr05G000242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=28.3; qcov=0.704; evalue=1.21e-31; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=28.9; qcov=0.572; evalue=1.31e-32; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057810280.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057810280.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810280.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810280.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057810280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1849828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C13
`Chr5:1849843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B100,B24,C23
`Chr5:1849885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B23
`Chr5:1849899`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B11,C37
`Chr5:1849899`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B11,C37
`Chr5:1849908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B140,D2
`Chr5:1849918`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B69,C68
`Chr5:1849918`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B69,C68
`Chr5:1849937`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A18,A2,A20,A22,B113,B12,B126,B135,B139,B2,B33,B39,B41,B46,B55,B71,B72,B73,B75,B89,C15,C52,C57,C70,C72,C78,C8,C85,D4,D5
`Chr5:1849961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C54
`Chr5:1849963`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A16,B101,B102,B117,B137,B3,B36,B46,B61,B97,C17,C21,C25,C31,C47,C52,C53,C6,C79,C86
`Chr5:1849966`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B117,B3,B36,B46,B61,C17,C21,C25,C31,C53,C6,C79,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810280.1

652 aa

326

652

NB-ARC

AAA_22

PF00931 NB-ARC 161-329 aa PF13401 AAA_22 177-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810280.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	161	329	3.3e-24	86.1	NB-ARC domain
`XP_057810280.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	177	281	6.7e-07	30.4	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954297.1
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCAACGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACCACCTGCCTACGACCAGATGGATCGCTTGCAGAAAGTTCTGCTCAAATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTTTGGATGAACTCATAAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTGCTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024758
ATGGCGGCTTATGGTGCAGCCACTTCTCTCAAGAATACGATTCAACGTATTCTACAATCGTCTCGCATTTCTCTCGTTTCCCACTCTCCACAAATCTTACCACCTGCCTACGACCAGATGGATCGCTTGCAGAAAGTTCTGCTCAAATTGGACGAGACCAGCTGCAGCAAGATCAGGACGAAGGTGAATGCTTTGGATGAACTCATAAAAGAGGCAGTTTGGGAATTCGAAGATTTGCTCGAATCCCATATCTTACCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810280.1
MAAYGAATSLKNTIQRILQSSRISLVSHSPQILPPAYDQMDRLQKVLLKLDETSCSKIRTKVNALDELIKEAVWEFEDLLESHILPQILPQLESERYNLSFSVDLQSLQHRVDCFVEKMKMMEEEYTNAMENMAEVEGEPISSRIDSGGMIKSKMVGLSHEFEKARDYLLEENNKLPYSIIGMAGVGKTTLAKRIFEDPSIRSRFEFRAWVRMGRKCESDELLRCVLAQVDPNAYEMLIQGDDDEEELVGLLKERLNDKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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