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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000244`

染色体: Chr05 坐标: 1869764-1871498 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000244`
名称	SmilChr05G000244
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-12
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1869764 - 1871498 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984964`
GeneID	`130984964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984964`
原始查询	`SmilChr05G000244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-12
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-12
Arabidopsis	`AT1G59218` (AT1G59218) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842234] identity=23.5; qcov=1.01; evalue=1.89e-10; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057763649.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057763649.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057763649.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763649.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1869939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:1869940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C8
`Chr5:1869967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:1869973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B56,C74
`Chr5:1870066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr5:1870068`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A2,B109,B117,B135,B75,B85,C3,C31,C34,C59,C74
`Chr5:1870075`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A2,B109,B117,B135,B75,B85,C11,C3,C31,C34,C59,C74
`Chr5:1870077`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A2,B109,B117,B135,B23,B75,B85,C11,C3,C31,C34,C59,C74,D7
`Chr5:1870107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B43,B95
`Chr5:1870116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:1870136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B56,C22,C61
`Chr5:1870175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763649.1

452 aa

226

452

LRR_14

PF23598 LRR_14 118-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763649.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	118	402	5.5e-16	59.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907666.1
TTCCCTCCATATATCGATATGATCAGACCATCCAAGCTCAACATTTTGTTCAGTGCTGAGGGGTCTTTTGAACCGATTGGAGGAGAAAGTTTTGAAGATTTTTTCCGTATATGCTTGAGAATGCTTTCTTTGGTGTATCATCTCGTTCTCGACACAACAAATCCATCTATCTTTTCGGAGAGAGAGTTTCGCGTGCATTCTTGCTGGCAGCACTTGTGTAAGGTAGAAGATAGTAGGATCAAGTTTTTGCATGTCTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130984964
ATGATCAGACCATCCAAGCTCAACATTTTGTTCAGTGCTGAGGGGTCTTTTGAACCGATTGGAGGAGAAAGTTTTGAAGATTTTTTCCGTATATGCTTGAGAATGCTTTCTTTGGTGTATCATCTCGTTCTCGACACAACAAATCCATCTATCTTTTCGGAGAGAGAGTTTCGCGTGCATTCTTGCTGGCAGCACTTGTGTAAGGTAGAAGATAGTAGGATCAAGTTTTTGCATGTCTTACAAAGTTGTGATGATGTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057763649.1
MIRPSKLNILFSAEGSFEPIGGESFEDFFRICLRMLSLVYHLVLDTTNPSIFSEREFRVHSCWQHLCKVEDSRIKFLHVLQSCDDVIKDQRRLCAHSNSLFGFKQVYDSIKSDCASTARSLLCFGRYHQYPVPIPAMGFKLLRVLYAHQVRFYHIPIEIFKLICLRYLALTCYGDLPISISNLFHLQFLIIDRHMRIIKRGVQSYMPVQIWDMQELKCIEILGSDLPTPNTDDASLNKLNTLLGVSVNSCTREVLKRIPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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