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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G000246`

染色体: Chr05 坐标: 1881277-1892280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G000246`
名称	SmilChr05G000246
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	1881277 - 1892280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130984966`
GeneID	`130984966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130984966`
原始查询	`SmilChr05G000246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a
Arabidopsis	`AT1G15780` (NRB4) mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838147] identity=62.2; qcov=0.342; evalue=1.02e-171; confidence=low
Rice	`Os08g0564800` (OsMED15_2) - identity=45.9; qcov=0.826; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031490 (chromatin DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF16987 (KIX_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130984966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057763651.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057763651.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057763651.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057763651.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057763651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:1881464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B47,B5,B73,C72
`Chr5:1881468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,B78
`Chr5:1882785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:1882812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr5:1882829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr5:1883850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B16,B62,C20,D3
`Chr5:1884455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr5:1884560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B82,C11,C69,D10
`Chr5:1884745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr5:1884752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr5:1884758`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr5:1884758`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057763651.1

1373 aa

686

1373

KIX_2

PF16987 KIX_2 33-110 aa

XP_057763652.1

1370 aa

685

1370

KIX_2

PF16987 KIX_2 33-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057763651.1`	Pfam	`PF16987`	KIX_2	Domain	33	110	5.3e-36	123.1	KIX domain
`XP_057763652.1`	Pfam	`PF16987`	KIX_2	Domain	33	110	5.3e-36	123.1	KIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057907668.1
CGAAATTATTCTAGATATGTGCGTAAATTAAATAAAATAATATTTTTTTTAATCAGAAAAAACACTAAATTACAAGGTTTTAAAATGGAAATTCCCTTTTTGTCTTTCGATAAAGAGAAGCAATAAATAACAATTATTGCAATAATGTATGTAGAAATACTTCTTCCTCTGCTCTTCGTTGCTACATAGATACCCTAACCCCAAACCCACTCACCTCCCACGCCACTCTATAAATCATCCATTTTTTGATTTGATTTTAC...

XM_057907669.1
AGAGAAGCAATAAATAACAATTATTGCAATAATGTATGTAGAAATACTTCTTCCTCTGCTCTTCGTTGCTACATAGATACCCTAACCCCAAACCCACTCACCTCCCACGCCACTCTATAAATCATCCATTTTTTGATTTGATTTTACAATTATTGCATTCCGCCACAACTCAATTTCCTCCAATTTCATCGCCGATCTCGCTCCCGCGCACGCTGATTCCTCTAAGGCGGCTGGAAATGGACAGCAACAATTGGCGGACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130984966
ATGGACAGCAACAATTGGCGGACGGCGCAGGGGCAGGTTCAGATGCCCGGTCAGGTCATCGGCGGCGAAGCAGTGCCCGCCGGCGGAATGGAAGGCGGCGATTGGAGGACTCAGCTGCAGCAGGACTCCAGACAGAGGATTGTGAACAAGATAATGGAGACATTGAAGAGGCATCTTCCTTTCTCTGGACAAGAGGGACTGCAAGAACTCAAGAAAATAGCCGTGAGATTTGAGGAAAAAATATATACTGCGGCAACTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057763651.1
MDSNNWRTAQGQVQMPGQVIGGEAVPAGGMEGGDWRTQLQQDSRQRIVNKIMETLKRHLPFSGQEGLQELKKIAVRFEEKIYTAATSQSDYLRKISLKMLTMETKSQNPMPNSLQSNAASNSKNPQDPASQSMQSQMQNQVQQLPIPMSNRQQILSQNIQNNIPSTGVPNSAGLTPAMPSVGMSQGTMPNVSVQNPNMQNMSNVTPNAVGNSMGQGVPANMYANSQRQIPGRQQQVGPQDSQQQPQNSQQYLYNQQQLQQ...

XP_057763652.1
MDSNNWRTAQGQVQMPGQVIGGEAVPAGGMEGGDWRTQLQQDSRQRIVNKIMETLKRHLPFSGQEGLQELKKIAVRFEEKIYTAATSQSDYLRKISLKMLTMETKSQNPMPNSLQSNAASNSKNPQDPASQSMQSQMQNQVQQLPIPMSNRQQILSQNIQNNIPSTGVPNSAGLTPAMPSVGMSQGTMPNVSVQNPNMQNMSNVTPNAVGNSMGQGVPANMYANSQRQIPGRQQQVGPQDSQQQPQNSQQYLYNQQQLQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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